JBPC Publications: 2011 - 2020

Years

2020 (27) | 2019 (46) | 2018 (32) | 2017 (37) | 2016 (49) | 2015 (58) | 2014 (68) | 2013 (42) | 2012 (47) | 2011 (42) | 2000-2010 | 1996-1999

2020

Utter DR, Borisy GG, Eren AM, Cavanaugh CM, Mark Welch JL. Metapangenomics of the oral microbiome provides insights into habitat adaptation and cultivar diversity. Genome Biol. 2020 Dec 16;21(1):293. doi: . PMID: 33323129; PMCID: PMC7739467.

Shaiber A, Willis AD, Delmont TO, Roux S, Chen LX, Schmid AC, Yousef M, Watson AR, Lolans K, Esen ÖC, Lee STM, Downey N, Morrison HG, Dewhirst FE, Mark Welch JL, Eren AM. Functional and genetic markers of niche partitioning among enigmatic members of the human oral microbiome. Genome Biol. 2020 Dec 16;21(1):292. doi: . PMID: 33323122; PMCID: PMC7739484.

Vakhrusheva OA, Mnatsakanova EA, Galimov YR, Neretina TV, Gerasimov ES, Naumenko SA, Ozerova SG, Zalevsky AO, Yushenova IA, Rodriguez F, Arkhipova IR, Penin AA, Logacheva MD, Bazykin GA, Kondrashov AS. Genomic signatures of recombination in a natural population of the bdelloid rotifer Adineta vaga. Nat Commun. 2020 Dec 18;11(1):6421. doi: . PMID: 33339818; PMCID: PMC7749112.

Arkhipova IR. Metagenome Proteins and Database Contamination. mSphere. 2020 Nov 4;5(6):e00854-20. doi: . PMID: 33148820; PMCID: PMC7643828.

Sieber CMK, Paul BG, Castelle CJ, Hu P, Tringe SG, Valentine DL, Andersen GL, Banfield JF. Unusual Metabolism and Hypervariation in the Genome of a Gracilibacterium (BD1-5) from an Oil-Degrading Community. mBio. 2019 Nov 12;10(6):e02128-19. doi: . PMID: 31719174; PMCID: PMC6851277.

Vallota-Eastman A, Arrington EC, Meeken S, Roux S, Dasari K, Rosen S, Miller JF, Valentine DL, Paul BG. Role of diversity-generating retroelements for regulatory pathway tuning in cyanobacteria. BMC Genomics. 2020 Sep 25;21(1):664. doi: . PMID: 32977771; PMCID: PMC7517822.

Mark Welch JL, Ramírez-Puebla ST, Borisy GG. Oral Microbiome Geography: Micron-Scale Habitat and Niche. Cell Host Microbe. 2020 Aug 12;28(2):160-168. doi: . PMID: 32791109; PMCID: PMC7604680.

Quigley CTC, Capistrant-Fossa KA, Morrison HG, Johnson LE, Morozov A, Hertzberg VS, Brawley SH. Bacterial Communities Show Algal Host (Fucus spp.)/Zone Differentiation Across the Stress Gradient of the Intertidal Zone. Front Microbiol. 2020 Sep 24;11:563118. doi: . PMID: 33072025; PMCID: PMC7541829.

Funikov SY, Rezvykh AP, Kulikova DA, Zelentsova ES, Protsenko LA, Chuvakova LN, Tyukmaeva VI, Arkhipova IR, Evgen91יev MB. Adaptation of gene loci to heterochromatin in the course of Drosophila evolution is associated with insulator proteins. Sci Rep. 2020 Jul 17;10(1):11893. doi: . PMID: 32681087; PMCID: PMC7368049.

Fowler BL, Neubert MG, Hunter-Cevera KR, Olson RJ, Shalapyonok A, Solow AR, Sosik HM. Dynamics and functional diversity of the smallest phytoplankton on the Northeast US Shelf. Proc Natl Acad Sci U S A. 2020 Jun 2;117(22):12215-12221. doi: . Epub 2020 May 15. PMID: 32414929; PMCID: PMC7275697.

Hernández CM, van Daalen SF, Caswell H, Neubert MG, Gribble KE. A demographic and evolutionary analysis of maternal effect senescence. Proc Natl Acad Sci U S A. 2020 Jul 14;117(28):16431-16437. doi: . PMID: 32601237; PMCID: PMC7368264.

Lemonnier, C., Perennou, M., Eveillard, D., Fernandez-Guerra, A., Leynaert, A., Marie, L., Morrison H. G., Memery L., Paillard C.,  Maignien, L. Linking Spatial and Temporal Dynamic of Bacterioplankton Communities With Ecological Strategies Across a Coastal Frontal Area. FRONTIERS IN MARINE SCIENCE. 2020 Jun 09; 7, 13 pages. doi:

Schlundt C, Mark Welch JL, Knochel AM, Zettler ER, Amaral-Zettler LA. Spatial structure in the 91לPlastisphere91ם: Molecular resources for imaging microscopic communities on plastic marine debris. Mol Ecol Resour. 2020 May;20(3):620-634. doi: . PMID: 31782619; PMCID: PMC7318237.

Hunter-Cevera KR, Neubert MG, Olson RJ, Shalapyonok A, Solow AR, Sosik HM. Seasons of Syn. Limnol Oceanogr. 2020 May;65(5):1085-1102. doi: . Epub 2019 Nov 19. PMID: 32612307; PMCID: PMC7319482.

Antosca K, Hoen AG, Palys T, Hilliard M, Morrison HG, Coker M, Madan J, Karagas MR. Reliability of stool microbiome methods for DNA yields and sequencing among infants and young children. Microbiologyopen. 2020 May;9(5):e1018. doi: . Epub 2020 Mar 12. PMID: 32166902; PMCID: PMC7221451.

Chakraborty, A, Ruff, SE, Dong, X, Ellefson, ED, Li, C, Brooks, JM, McBee, J, Bernard, BB, & Hubert, CRJ. Hydrocarbon seepage in the deep seabed links subsurface and seafloor biospheres. Proc Natl Acad Sci U S A.  2020 May; 117(20), 11029-11037. doi:  PMID: 32354993; PMCID: PMC7245137

Grettenberger, CL, McCauley Rench, RL, Gruen, DS, Mills, DB, Carney, C, Brainard, J, Hamasaki, H, Ramirez, R, Watanabe, Y, Amaral-Zettler, LA, Ohmoto, H, & Macalady, JL. Microbial population structure in a stratified, acidic pit lake in the Iberian Pyrite Belt. GEOMICROBIOLOGY JOURNAL. 2020 Apr11; 37(7), 623-634. doi: .

Chen, LX, Anantharaman, K, Shaiber, A, Eren, AM, & Banfield, JF. Accurate and complete genomes from metagenomes. Genome Research. 2020 March 30(3), 315-333. doi:   PMID: 32188701; PMCID: PMC7111523

Dai, Z, Sevillano-Rivera, MC, Calus, ST, Bautista-de Los Santos, QM, Eren, AM, van der Wielen, P, Ijaz, UZ, & Pinto, AJ. Disinfection exhibits systematic impacts on the drinking water microbiome. Microbiome. 2020 March20; 8(1), 42. doi: . PMID: 32197656; PMCID: PMC7085177

Wilbert SA, Mark Welch JL, Borisy GG. Spatial Ecology of the Human Tongue Dorsum Microbiome. Cell Rep. 2020 Mar 24;30(12):4003-4015.e3. doi: . PMID: 32209464; PMCID: PMC7179516.

Amaral-Zettler LA, Zettler ER, Mincer TJ. Ecology of the plastisphere. Nat Rev Microbiol. 2020 Mar;18(3):139-151. doi: . PMID: 31937947.

Rossetti BJ, Wilbert SA, Mark Welch JL, Borisy GG, Nagy JG. Semi-blind sparse affine spectral unmixing of autofluorescence-contaminated micrographs. Bioinformatics. 2020 Feb 1;36(3):910-917. doi: . PMID: 31504202; PMCID: PMC7523684.

Kuloyo, O, Ruff, SE, Cahill, A, Connors, L, Zorz, JK, Hrabe de Angelis, I, Nightingale, M, Mayer, B, & Strous, M. Methane oxidation and methylotroph population dynamics in groundwater mesocosms. Environ Microbiology. 2020 Feb03; 22(4), 1222-1237. doi:  PMID: 32017377; PMCID: PMC7187433

Bhatnagar, S, Cowley, ES, Kopf, SH, Castro, SP, Kearney, S, Dawson, SC, Hanselmann, K, & Ruff, SE. Microbial community dynamics and coexistence in a sulfide-driven phototrophic bloom. Environmental Microbiome. 2020 Jan; 15(1). doi:  

Coker MO, Hoen AG, Dade E, Lundgren S, Li Z, Wong AD, Zens MS, Palys TJ, Morrison HG, Sogin ML, Baker ER, Karagas MR, Madan JC. Specific class of intrapartum antibiotics relates to maturation of the infant gut microbiota: a prospective cohort study. BJOG. 2020 Jan;127(2):217-227. doi: . PMID: 31006170; PMCID: PMC6803026.

Gurdebeke PR,  Mertens KN, Pospelova V, Matsuoka K, Li Z, Gribble KE, Gu H, Bogus K, Vrielinck H & Louwye S. Taxonomic revision, phylogeny, and cyst wall composition of the dinoflagellate cyst genus Votadinium Reid (Dinophyceae, Peridiniales, Protoperidiniaceae), Palynology. 2020; 44:2,310-335, doi: 

Martiny JBH, Whiteson KL, Bohannan BJM, David LA, Hynson NA, McFall-Ngai M, Rawls JF, Schmidt TM, Abdo Z, Blaser MJ, Bordenstein S, Bréchot C, Bull CT, Dorrestein P, Eisen JA, Garcia-Pichel F, Gilbert J, Hofmockel KS, Holtz ML, Knight R, Mark Welch DB, McDonald D, Methé B, Mouncey NJ, Mueller NT, Pfister CA, Proctor L, Sachs JL. The emergence of microbiome centres. Nat Microbiol. 2020 Jan;5(1):2-3. doi: . PMID: 31857734.

2019

Lundgren SN, Madan JC, Karagas MR, Morrison HG, Hoen AG, Christensen BC. Microbial Communities in Human Milk Relate to Measures of Maternal Weight. Front Microbiol. 2019 Dec 20;10:2886. doi: . PMID: 31921063; PMCID: PMC6933483.

Sharko FS, Nedoluzhko AV, Lê BM, Tsygankova SV, Boulygina ES, Rastorguev SM, Sokolov AS, Rodriguez F, Mazur AM, Polilov AA, Benton R, Evgen91יev MB, Arkhipova IR, Prokhortchouk EB, Skryabin KG. A partial genome assembly of the miniature parasitoid wasp, Megaphragma amalphitanum. PLoS One. 2019 Dec 23;14(12):e0226485. doi: . PMID: 31869362; PMCID: PMC6927652.

Antosca KM, Chernikova DA, Price CE, Ruoff KL, Li K, Guill MF, Sontag NR, Morrison HG, Hao S, Drumm ML, MacKenzie TA, Dorman DB, Feenan LM, Williams MA, Dessaint J, Yuan IH, Aldrich BJ, Moulton LA, Ting L, Martinez-Del Campo A, Stewart EJ, Karagas MR, O91יToole GA, Madan JC. Altered Stool Microbiota of Infants with Cystic Fibrosis Shows a Reduction in Genera Associated with Immune Programming from Birth. J Bacteriol. 2019 Jul 24;201(16):e00274-19. doi: 1. PMID: 31209076; PMCID: PMC6657602.

Ivashkin E, Melnikova V, Kurtova A, Brun NR, Obukhova A, Khabarova MY, Yakusheff A, Adameyko I, Gribble KE, Voronezhskaya EE. Transglutaminase Activity Determines Nuclear Localization of Serotonin Immunoreactivity in the Early Embryos of Invertebrates and Vertebrates. ACS Chem Neurosci. 2019 Aug 21;10(8):3888-3899. doi: . Epub 2019 Jul 23. PMID: 31291540.

Mark Welch JL, Dewhirst FE, Borisy GG. Biogeography of the Oral Microbiome: The Site-Specialist Hypothesis. Annu Rev Microbiol. 2019 Sep 8;73:335-358. doi: . Epub 2019 Jun 10. PMID: 31180804; PMCID: PMC7153577.

Cavicchioli R, Ripple WJ, Timmis KN, Azam F, Bakken LR, Baylis M, Behrenfeld MJ, Boetius A, Boyd PW, Classen AT, Crowther TW, Danovaro R, Foreman CM, Huisman J, Hutchins DA, Jansson JK, Karl DM, Koskella B, Mark Welch DB, Martiny JBH, Moran MA, Orphan VJ, Reay DS, Remais JV, Rich VI, Singh BK, Stein LY, Stewart FJ, Sullivan MB, van Oppen MJH, Weaver SC, Webb EA, Webster NS. Scientists91י warning to humanity: microorganisms and climate change. Nat Rev Microbiol. 2019 Sep;17(9):569-586. doi: . Epub 2019 Jun 18. PMID: 31213707; PMCID: PMC7136171.

Blommaert J, Riss S, Hecox-Lea B, Mark Welch DB, Stelzer CP. Small, but surprisingly repetitive genomes: transposon expansion and not polyploidy has driven a doubling in genome size in a metazoan species complex. BMC Genomics. 2019 Jun 7;20(1):466. doi: . PMID: 31174483; PMCID: PMC6555955.

Gurdebeke, P. R., Mertens, K. N., Pospelova, V., Matsuoka, K., Li, Z., Gribble, K. E., Gu, H., Bogus, K., Vrielinck, H., & Louwye, S. (2019). 91ל91ם&Բ;Palynology, 1-26. doi:10.1080/01916122.2019.158062.

Kivenson V, Lemkau KL, Pizarro O, Yoerger DR, Kaiser C, Nelson RK, Carmichael C, Paul BG, Reddy CM, Valentine DL. Ocean Dumping of Containerized DDT Waste Was a Sloppy Process. Environ Sci Technol. 2019 Mar 19;53(6):2971-2980. doi: . Epub 2019 Mar 4. PMID: 30829032.

Dobay A, Haas C, Fucile G, Downey N, Morrison HG, Kratzer A, Arora N. Microbiome-based body fluid identification of samples exposed to indoor conditions. Forensic Sci Int Genet. 2019 May;40:105-113. doi: . Epub 2019 Feb 11. PMID: 30785061.

Lutz HL, Ramírez-Puebla ST, Abbo L, Durand A, Schlundt C, Gottel NR, Sjaarda AK, Hanlon RT, Gilbert JA, Mark Welch JL. A Simple Microbiome in the European Common Cuttlefish, Sepia officinalis. mSystems. 2019 May 14;4(4):e00177-19. doi: . PMID: 31098396; PMCID:
PMC6517690.

Arkhipova IR, Yushenova IA. Giant Transposons in Eukaryotes: Is Bigger Better? Genome Biol Evol. 2019 Mar 1;11(3):906-918. doi: . PMID: 30796812; PMCID: PMC6431247.

Hubbard CJ, Li B, McMinn R, Brock MT, Maignien L, Ewers BE, Kliebenstein D, Weinig C. The effect of rhizosphere microbes outweighs host plant genetics in reducing insect herbivory. Mol Ecol. 2019 Apr;28(7):1801-1811. doi: . Epub 2019 Feb 6. PMID: 30582660.

Bock MJ, Jarvis GC, Corey EL, Stone EE, Gribble KE. Maternal age alters offspring lifespan, fitness, and lifespan extension under caloric restriction. Sci Rep. 2019 Feb 28;9(1):3138. doi: . PMID: 30816287; PMCID: PMC6395700.

Trigodet F, Larché N, Morrison HG, Jebbar M, Thierry D, Maignien L. Electroactive Bacteria Associated With Stainless Steel Ennoblement in Seawater. Front Microbiol. 2019 Feb 7;10:170. doi: . PMID: 30792705; PMCID: PMC6374330.

Ecklu-Mensah, G., Sackey, S. T., Morrison, H. G., Sogin, M. L., Murphy, L. G., & Reznikoff, W. S. (2019). Assessment of bacterial diversity in western Accra, Ghana, drinking water samples. JOURNAL OF WATER SANITATION AND HYGIENE FOR DEVELOPMENT, 9(4), 644-661. doi:

Bhatnagar, S., Cowley, E. S., Kopf, S. H., Castro, S. P., Kearney, S., Dawson, S. C., Hanselmann, K., & Ruff, S. E. (2019). 91ל91ם&Բ;bioRxiv, 604504. doi:10.1101/60450.

Bono, L. M., Orton, R. J., Peredo, E. L., Morrison, H. G., Sistrom, M., Simmons, S., & Turner, P. E. (2019). 91ל91ם&Բ;bioRxiv, 772475. doi:10.1101/77247.

Coker, M. O., Hoen, A. G., Dade, E., Lundgren, S., Li, Z., Wong, A. D., Zens, M. S., Palys, T. J., Morrison, H. G., Sogin, M. L., Baker, E. R., Karagas, M. R., & Madan, J. C. (2019). 91ל91ם&Բ;BJOG, 0(0), 0. doi:10.1111/1471-0528.1579.

Cramm, M. A., Chakraborty, A., Li, C., Ruff, S. E., Jorgensen, B. B., & Hubert, C. R. J. (2019). 91ל91ם&Բ;Front Microbiol, 10, 945. doi:10.3389/fmicb.2019.0094.

Delmont, T. O., Kiefl, E., Kilinc, O., Esen, O. C., Uysal, I., Rappe, M. S., Giovannoni, S., &  (2019). 91ל91ם&Բ;Elife, 8(ARTN e46497). doi:10.7554/eLife.4649.

Edsinger, E., Pnini, R., Ono, N., Yanagisawa, R., Dever, K., & Miller, J. (2019). 91ל91ם&Բ;bioRxiv, 526905. doi:10.1101/52690.

Fiore-Donno, A. M., Richter-Heitmann, T., Degrune, F., Dumack, K., Regan, K., Mahran, S., Boeddinghaus, R., Rillig, M., Friedrich, M. W., Kandeler, E., & Bonkowski, M. (2019). 91ל91ם&Բ;bioRxiv, 531970. doi:10.1101/53197.

Funikov, S. Y., Rezvykh, A. P., Kulikova, D. A., Zelentsova, E. S., Chuvakova, L. N., Tyukmaeva, V. I., Arkhipova, I. R., & Evgen91יev, M. B. (2019). 91ל91ם&Բ;bioRxiv, 802371. doi:10.1101/80237.

Goldmann, K., Boeddinghaus, R. S., Klemmer, S., Regan, K. M., Heintz-Buschart, A., Fischer, M., Prati, D., Piepho, H. P., Berner, D., Marhan, S., Kandeler, E., Buscot, F., & Wubet, T. (2019). 91ל91ם&Բ;Environ Microbiol, 0(0). doi:10.1111/1462-2920.1465.

Han, M., Dsouza, M., Zhou, C., Li, H., Zhang, J., Chen, C., Yao, Q., Zhong, C., Zhou, H., , Wang, Z., & Ning, K. (2019). 91ל91ם&Բ;Genomics Proteomics Bioinformatics, 17(1), 76-90. doi:10.1016/j.gpb.2018.04.00.

McKay, L. J., Dlakic, M., Fields, M. W., Delmont, T. O., , Jay, Z. J., Klingelsmith, K. B., Rusch, D. B., & Inskeep, W. P. (2019). 91ל91ם&Բ;Nat Microbiol, 4(4), 614-622. doi:10.1038/s41564-019-0362-.

Mincer, T. J., Zettler, E. R., & Amaral-Zettler, L. A. (2019). 91ל91ם&Բ;In H. Takada & H. K. Karapanagioti (Ed.), Hazardous Chemicals Associated with Plastics in the Marine Environment (pp. 221-233): Cham: Springer International Publishing.

Nedoluzhko, A. V., Sharko, F. S., Lê, B. M., Tsygankova, S. V., Boulygina, E. S., Rastorguev, S. M., Sokolov, A. S., Rodriguez, F., Mazur, A. M., Polilov, A. A., Benton, R., Evgen91יev, M. B., Arkhipova, I. R., Prokhortchouk, E. B., & Skryabin, K. G. (2019). 91ל91ם&Բ;bioRxiv, 579052. doi:10.1101/57905.

Nissimov, J. I., Talmy, D., Haramaty, L., Fredricks, H. F., Zelzion, E., Knowles, B., , Vandzura, R., Laber, C. P., Schieler, B. M., Johns, C. T., More, K. D., Coolen, M. J. L., Follows, M. J., Bhattacharya, D., Van Mooy, B. A. S., & Bidle, K. D. (2019). 91ל91ם&Բ;Environ Microbiol, 21(6), 2182-2197. doi:10.1111/1462-2920.1463.

Peramba, K. B., & Edsinger, E. (2019). 91ל91ם&Բ;Paper presented at the Annual Meeting of the Society for Integrative and Comparative Biology, Tampa, FL.

Peramba, K. B., Nash, C., Walters, D., Hackworth, L., Schumm, M., Pineda, O., & Edsinger, E. (2019). 91ל91ם&Բ;Paper presented at the Annual Meeting of the Society for Integrative and Comparative Biology, Tampa, FL.

Perez Castro, S., Cleland, E. E., Wagner, R., Sawad, R. A., & Lipson, D. A. (2019). 91ל91ם&Բ;ISME J, 13(7), 1776-1787. doi:10.1038/s41396-019-0389-.

Puritty, C. E., Esch, E. H., Castro, S. P., Ryan, E. M., Lipson, D. A., & Cleland, E. E. (2019). 91ל91ם&Բ;Plant Ecology, 220(2), 151-169. doi:10.1007/s11258-019-00912-.

, Bordenstein, S. R., Cruaud, C., Shaiber, A., Esen, O. C., Weill, M., Makoundou, P., Lolans, K., Watson, A. R., Rakotoarivony, I., Bordenstein, S. R., &  (2019). 91ל91ם&Բ;Nat Commun, 10(1), 1051. doi:10.1038/s41467-019-08973-.

Richter, N., Longo, W. M., George, S., Shipunova, A., Huang, Y., & Amaral-Zettler, L. (2019). 91ל91ם&Բ;Geobiology, 17(3), 272-280. doi:10.1111/gbi.1233.

Rossetti, B. J., Wilbert, S. A., Mark Welch, J. L., , & Nagy, J. G. (2019). 91ל91ם&Բ;bioRxiv, 674. doi:10.1093/bioinformatics/btz67.

Ruff, S. E. (2019). 91ל91ם&Բ;In A. Teske & V. Carvalho (Ed.), Marine Hydrocarbon Seeps 91ד Microbiology and Biogeochemistry of a Global Marine Habitat (pp. 280): Springer.

Ruff, S. E., Felden, J., Gruber-Vodicka, H. R., Marcon, Y., Knittel, K., Ramette, A., & Boetius, A. (2019). 91ל91ם&Բ;ISME J, 13(1), 197-213. doi:10.1038/s41396-018-0263-.

Sevillano, M., Dai, Z., Calus, S., Bautista-de los Santos, Q. M., , van der Wielen, P. W. J. J., Ijaz, U. Z., & Pinto, A. J. (2019). 91ל91ם&Բ;bioRxiv, 675561. doi:10.1101/67556.

Shaiber, A., &  (2019). 91ל91ם&Բ;MBio, 10(3), e00725-00719. doi:10.1128/mBio.00725-1.

Theroux, S., Huang, Y. S., Toney, J. L., Andersen, R., Nyren, P., Bohn, R., Salacup, J., Murphy, L., & Amaral-Zettler, L. (2019). 91ל91ם&Բ;Limnology and Oceanography, 0(0), 11311. doi:10.1002/lno.1131.

Trigodet, F., Larché, N., Morrison, H. G., Maignien, L., & Thierry, D. (2019). 91ל91ם&Բ;Materials and Corrosion, 0(0). doi:10.1002/maco.20191122.

Watterson, W. J., Tanyeri, M., Watson, A. R., Cham, C. M., Shan, Y., Chang, E. B., , & Tay, S. (2019). 91ל91ם&Բ;bioRxiv, 759969. doi:10.1101/75996.

Yeoman, C. J., Brutscher, L. M., Esen, O. C., Ibaoglu, F., Fowler, C., , Wanner, K., & Weaver, D. K. (2019). 91ל91ם&Բ;PeerJ, 7, e7548. doi:10.7717/peerj.754.

2018

Abrams, J. M., Arkhipova, I. R., , Boeke, J. D., Joan Curcio, M., Faulkner, G. J., Goodier, J. L., Lehmann, R., & Levin, H. L. (2018). 91ל91ם&Բ;Mob DNA, 9(ARTN 21), 21. doi:10.1186/s13100-018-0126-.

Amaral-Zettler, L. A., Schmidt, V., & Smith, K. F. (2018). 91ל91ם&Բ;Microorganisms, 6(3). doi:10.3390/microorganisms603009.

Arkhipova, I. R. (2018). 91ל91ם&Բ;Mol Biol Evol, 35(6), 1332-1337. doi:10.1093/molbev/msy08.

Bowers, R. M., Kyrpides, N. C., Stepanauskas, R., Harmon-Smith, M., Doud, D., Reddy, T. B. K., Schulz, F., Jarett, J., Rivers, A. R., Eloe-Fadrosh, E. A., Tringe, S. G., Ivanova, N. N., Copeland, A., Clum, A., Becraft, E. D., Malmstrom, R. R., Birren, B., Podar, M., Bork, P., Weinstock, G. M., Garrity, G. M., Dodsworth, J. A., Yooseph, S., Sutton, G., Glockner, F. O., , Nelson, W. C., Hallam, S. J., Jungbluth, S. P., Ettema, T. J. G., Tighe, S., Konstantinidis, K. T., Liu, W. T., Baker, B. J., Rattei, T., Eisen, J. A., Hedlund, B., McMahon, K. D., Fierer, N., Knight, R., Finn, R., Cochrane, G., Karsch-Mizrachi, I., Tyson, G. W., Rinke, C., Genome Standards, C., Lapidus, A., Meyer, F., Yilmaz, P., Parks, D. H., , Schriml, L., Banfield, J. F., Hugenholtz, P., & Woyke, T. (2018). 91ל91ם&Բ;Nat Biotechnol, 36(2), 196. doi:10.1038/nbt0218-196.

Burnett, K., Edsinger, E., & Albrecht, D. R. (2018). 91ל91ם&Բ;Commun Biol, 1(1), 73. doi:10.1038/s42003-018-0079-.

Chafee, M., Fernandez-Guerra, A., Buttigieg, P. L., Gerdts, G., , Teeling, H., & Amann, R. I. (2018). 91ל91ם&Բ;ISME J, 12(1), 237-252. doi:10.1038/ismej.2017.16.

Chernikova, D. A., Madan, J. C., Housman, M. L., Zain-Ul-Abideen, M., Lundgren, S. N., Morrison, H. G., Sogin, M. L., Williams, S. M., Moore, J. H., Karagas, M. R., & Hoen, A. G. (2018). 91ל91ם&Բ;Pediatr Res, 84(1), 71-79. doi:10.1038/s41390-018-0022-.

Crognale, S., Venturi, S., Tassi, F., Rossetti, S., Rashed, H., Cabassi, J., Capecchiacci, F., Nisi, B., Vaselli, O., Morrison, H. G., Sogin, M. L., & Fazi, S. (2018). 91ל91ם&Բ;FEMS Microbiol Ecol, 94(12), fiy190-fiy190. doi:10.1093/femsec/fiy19.

Delmont, T. O., &  (2018). 91ל91ם&Բ;PeerJ, 6(ARTN e4320), e4320. doi:10.7717/peerj.432.

Delmont, T. O., Quince, C., Shaiber, A., Esen, O. C., Lee, S. T., Rappe, M. S., McLellan, S. L., Lucker, S., &  (2018). 91ל91ם&Բ;Nat Microbiol, 3(7), 804-813. doi:10.1038/s41564-018-0176-.

Dever, K., Carr, J., Girard, J., Calzarette, D., Remsen, D., Gage, G., Chugunov, I., Weissbourd, B., Cordeiro, M., Miao, J., Marvel-Zuccola, J., Newstein, P., Peramba, K., & Edsinger, E. (2018). 91ל91ם&Բ;Paper presented at the Annual Meeting of the Society for Integrative and Comparative Biology, San Francisco, CA.

Edsinger, E., & Dolen, G. (2018). 91ל91ם&Բ;Curr Biol, 28(19), 3136-3142 e3134. doi:10.1016/j.cub.2018.07.06.

Frere, L., Maignien, L., Chalopin, M., Huvet, A., Rinnert, E., Morrison, H., Kerninon, S., Cassone, A. L., Lambert, C., , & Paul-Pont, I. (2018). 91ל91ם&Բ;Environ Pollut, 242(Pt A), 614-625. doi:10.1016/j.envpol.2018.07.02.

 (2018). 91ל91ם&Բ;mSystems, 3(2). doi:10.1128/mSystems.00002-1.

Grahl, N., Dolben, E. L., Filkins, L. M., Crocker, A. W., Willger, S. D., Morrison, H. G., Sogin, M. L., Ashare, A., Gifford, A. H., Jacobs, N. J., Schwartzman, J. D., & Hogan, D. A. (2018). 91ל91ם&Բ;mSphere, 3(4). doi:10.1128/mSphere.00292-1.

Gribble, K. E., Moran, B. M., Jones, S., Corey, E. L., & Mark Welch, D. B. (2018). 91ל91ם&Բ;Exp Gerontol, 114, 99-106. doi:10.1016/j.exger.2018.10.02.

Hecox-Lea, B. J., & Mark Welch, D. B. (2018). 91ל91ם&Բ;BMC Evol Biol, 18(1), 177. doi:10.1186/s12862-018-1288-.

Hoen, A. G., Madan, J. C., Li, Z., Coker, M., Lundgren, S. N., Morrison, H. G., Palys, T., Jackson, B. P., Sogin, M. L., Cottingham, K. L., & Karagas, M. R. (2018). 91ל91ם&Բ;Sci Rep, 8(1), 12627. doi:10.1038/s41598-018-30581-.

Hubbard, C. J., Brock, M. T., van Diepen, L. T., Maignien, L., Ewers, B. E., & Weinig, C. (2018). 91ל91ם&Բ;ISME J, 12, 400-410.

Kroeger, M. E., Delmont, T. O., , Meyer, K. M., Guo, J., Khan, K., Rodrigues, J. L. M., Bohannan, B. J. M., Tringe, S. G., Borges, C. D., Tiedje, J. M., Tsai, S. M., & Nusslein, K. (2018). 91ל91ם&Բ;Front Microbiol, 9(ARTN 1635), 1635. doi:10.3389/fmicb.2018.0163.

Lang, J. M., Coil, D. A., Neches, R. Y., Brown, W. E., Cavalier, D., Severance, M., Hampton-Marcell, J. T., , & Eisen, J. A. (2018). 91ל91ם&Բ;PeerJ, 5. doi:10.7717/peerj.4029/correction-.

Lundgren, S. N., Madan, J. C., Emond, J. A., Morrison, H. G., Christensen, B. C., Karagas, M. R., & Hoen, A. G. (2018). 91ל91ם&Բ;Microbiome, 6(1), 109. doi:10.1186/s40168-018-0490-.

McIntosh, C. M., Chen, L., Shaiber, A., , & Alegre, M. L. (2018). 91ל91ם&Բ;Microbiome, 6(1), 96. doi:10.1186/s40168-018-0474-.

Meisel, M., Hinterleitner, R., Pacis, A., Chen, L., Earley, Z. M., Mayassi, T., Pierre, J. F., Ernest, J. D., Galipeau, H. J., Thuille, N., Bouziat, R., Buscarlet, M., Ringus, D. L., Wang, Y., Li, Y., Dinh, V., Kim, S. M., McDonald, B. D., Zurenski, M. A., Musch, M. W., Furtado, G. C., Lira, S. A., Baier, G., Chang, E. B., , Weber, C. R., Busque, L., Godley, L. A., Verdu, E. F., Barreiro, L. B., & Jabri, B. (2018). 91ל91ם&Բ;Nature, 557(7706), 580-584. doi:10.1038/s41586-018-0125-.

Peñalver Bernabé, B., Cralle, L., &  (2018). 91ל91ם&Բ;Curr Opin Biotechnol, 51, 146-153. doi:10.1016/j.copbio.2018.01.01.

Quigley, C. T. C., Morrison, H. G., Mendonca, I. R., & Brawley, S. H. (2018). 91ל91ם&Բ;J Phycol, 54(5), 653-664. doi:10.1111/jpy.1276.

Rodriguez, F., & Arkhipova, I. R. (2018). 91ל91ם&Բ;Curr Opin Genet Dev, 49, 115-123. doi:10.1016/j.gde.2018.04.00.

Seyler, L. M., McGuinness, L. R., , Biddle, J. F., Gong, D., & Kerkhof, L. J. (2018). 91ל91ם&Բ;FEMS Microbiol Ecol, 94(3). doi:10.1093/femsec/fiy01.

Sheik, C. S., Reese, B. K., Twing, K. I., Sylvan, J. B., Grim, S. L., Schrenk, M. O., Sogin, M. L., & Colwell, F. S. (2018). 91ל91ם&Բ;Front Microbiol, 9(ARTN 840), 840. doi:10.3389/fmicb.2018.0084.

Vakhrusheva, O. A., Mnatsakanova, E. A., Galimov, Y. R., Neretina, T. V., Gerasimov, E. S., Ozerova, S. G., Zalevsky, A. O., Yushenova, I. A., Arkhipova, I. R., Penin, A. A., Logacheva, M. D., Bazykin, G. A., & Kondrashov, A. S. (2018). 91ל91ם&Բ;bioRxiv, 489393. doi:10.1101/48939.

Yushenova, I. A., & Arkhipova, I. R. (2018). 91ל91ם&Բ;Curr Genet, 64(6), 1287-1301. doi:10.1007/s00294-018-0844-.

Zhang, X., Xia, K., Lin, L., Zhang, F., Yu, Y., St Ange, K., Han, X., Edsinger, E., Sohn, J., & Linhardt, R. J. (2018). 91ל91ם&Բ;ACS Chem Biol, 13(6), 1677-1685. doi:10.1021/acschembio.8b0033.

2017

Amaral-Zettler, L. A., Dragone, N. B., Schell, J., Slikas, B., Murphy, L. G., Morrall, C. E., & Zettler, E. R. (2017). 91לComparative mitochondrial and chloroplast genomics of a genetically distinct form of Sargassum contributing to recent 91לGolden Tides91ם in the Western Atlantic.91ם&Բ;Ecol Evol, 7(2), 516-525. doi:10.1002/ece3.263.

Anderson, R. E., , , Delmont, T. O., , McDermott, J. M., Seewald, J. S., &  (2017). 91ל91ם&Բ;Nat Commun, 8(1), 1114. doi:10.1038/s41467-017-01228-.

Arkhipova, I. R., Yushenova, I. A., & Rodriguez, F. (2017). 91ל91ם&Բ;Mol Biol Evol, 34(9), 2245-2257. doi:10.1093/molbev/msx15.

Bowers, R. M., Kyrpides, N. C., Stepanauskas, R., Harmon-Smith, M., Doud, D., Reddy, T. B. K., Schulz, F., Jarett, J., Rivers, A. R., Eloe-Fadrosh, E. A., Tringe, S. G., Ivanova, N. N., Copeland, A., Clum, A., Becraft, E. D., Malmstrom, R. R., Birren, B., Podar, M., Bork, P., Weinstock, G. M., Garrity, G. M., Dodsworth, J. A., Yooseph, S., Sutton, G., Glockner, F. O., , Nelson, W. C., Hallam, S. J., Jungbluth, S. P., Ettema, T. J. G., Tighe, S., Konstantinidis, K. T., Liu, W. T., Baker, B. J., Rattei, T., Eisen, J. A., Hedlund, B., McMahon, K. D., Fierer, N., Knight, R., Finn, R., Cochrane, G., Karsch-Mizrachi, I., Tyson, G. W., Rinke, C., Lapidus, A., Meyer, F., Yilmaz, P., Parks, D. H., , Schriml, L., Banfield, J. F., Hugenholtz, P., Woyke, T., & Consortium, G. S. (2017). 91ל91ם&Բ;Nature Biotechnology, 35(8), 725-731. doi:10.1038/nbt.389.

Bowman, J. S., Amaral-Zettler, L. A., J, J. R., C, M. L., & Ducklow, H. W. (2017). 91ל91ם&Բ;ISME J, 11(6), 1460-1471. doi:10.1038/ismej.2016.20.

Courtine, D., Alain, K., Georges, M., Bienvenu, N., Morrison, H. G., , & Maignien, L. (2017). 91ל91ם&Բ;EXT12c, Isolated from the East Pacific Rise 9 degrees N. Genome Announc, 5(50). doi:10.1128/genomeA.01385-1.

De Tender, C., Schlundt, C., Devriese, L. I., Mincer, T. J., Zettler, E. R., & Amaral-Zettler, L. A. (2017). 91ל91ם&Բ;Analytical Methods, 9(14), 2132-2143. doi:10.1039/c7ay00260.

Delmont, T. O., &  (2017). 91ל91ם&Բ;Proc Natl Acad Sci U S A, 114(43), E8947-E8949. doi:10.1073/pnas.171218611.

Devetter, M., Fontaneto, D., Jersabek, C. D., Mark Welch, D. B., May, L., & Walsh, E. J. (2017). 91ל91ם&Բ;Hydrobiologia, 796(1), 1-6. doi:10.1007/s10750-017-3241-.

Doherty, M., Yager, P. L., Moran, M. A., Coles, V. J., , Krusche, A. V., Medeiros, P. M., Payet, J. P., Richey, J. E., Satinsky, B. M., Sawakuchi, H. O., Ward, N. D., & Crump, B. C. (2017). 91ל91ם&Բ;Front Microbiol, 8, 882. doi:10.3389/fmicb.2017.0088.

Fan, K. K., Cardona, C., Li, Y. T., Shi, Y., Xiang, X. J., Shen, C. C., Wang, H. F., , & Chu, H. Y. (2017). 91ל91ם&Բ;Soil Biology & Biochemistry, 113(Supplement C), 275-284. doi:10.1016/j.soilbio.2017.06.02.

Franco-Obregon, A., &  (2017). 91ל91ם&Բ;mSystems, 2(3). doi:10.1128/mSystems.00018-1.

Gibbons, S. M., Lekberg, Y., Mummey, D. L., Sangwan, N., Ramsey, P. W., &  (2017). 91ל91ם&Բ;mSystems, 2(2). doi:10.1128/mSystems.00178-1.

 (2017). 91ל91ם&Բ;Microb Biotechnol, 10(1), 11-13. doi:10.1111/1751-7915.1243.

Gribble, K. E., & Mark Welch, D. B. (2017). 91ל91ם&Բ;BMC Genomics, 18(1), 217. doi:10.1186/s12864-017-3540-.

Hasegawa, Y., Mark Welch, J. L., Rossetti, B. J., &  (2017). 91ל91ם&Բ;PLoS One, 12(11), e0188257. doi:10.1371/journal.pone.018825.

Herfort, L., Crump, B. C., , McCue, L. A., Campbell, V., Simon, H. M., Baptista, A. M., & Zuber, P. (2017). 91ל91ם&Բ;Microbiologyopen, 6(6), e00522-n/a. doi:10.1002/mbo3.52.

Huang, Y., Dalal, S., Antonopoulos, D., Hubert, N., Raffals, L. H., Dolan, K., Weber, C., Messer, J. S., Jabri, B., Bendelac, A., , Rubin, D. T., Sogin, M., & Chang, E. B. (2017). 91ל91ם&Բ;Inflamm Bowel Dis, 23(3), 366-378. doi:10.1097/MIB.000000000000102.

Knight, R., Callewaert, C., Marotz, C., Hyde, E. R., Debelius, J. W., McDonald, D., & Sogin, M. L. (2017). 91ל91ם&Բ;Annu Rev Genomics Hum Genet, 18, 65-86. doi:10.1146/annurev-genom-083115-02243.

Kumar, R., Verma, H., Haider, S., Bajaj, A., Sood, U., Ponnusamy, K., Nagar, S., Shakarad, M. N., Negi, R. K., Singh, Y., Khurana, J. P., , & Lal, R. (2017). 91ל91ם&Բ;mSystems, 2(3). doi:10.1128/mSystems.00020-1.

Kuntz, T. M., &  (2017). 91ל91ם&Բ;Trends Pharmacol Sci, 38(1), 81-91. doi:10.1016/j.tips.2016.10.00.

Lee, S. T. M., Kahn, S. A., Delmont, T. O., Shaiber, A., Esen, O. C., Hubert, N. A., Morrison, H. G., Antonopoulos, D. A., Rubin, D. T., &  (2017). 91ל91ם&Բ;Microbiome, 5(1), 50. doi:10.1186/s40168-017-0270-.

Luria, C. M., Amaral-Zettler, L. A., Ducklow, H. W., Repeta, D. J., Rhyne, A., & Rich, J. J. (2017). 91ל91ם&Բ;Frontiers in Microbiology-Aquatic Microbiology, 8, 2117.

Ma, B., Dai, Z., Wang, H., Dsouza, M., Liu, X., He, Y., Wu, J., Rodrigues, J. L., , Brookes, P. C., & Xu, J. (2017). 91ל91ם&Բ;mSystems, 2(1). doi:10.1128/mSystems.00174-1.

Mackey, K. R. M., Hunter-Cevera, K., Britten, G. L., Murphy, L. G., Sogin, M. L., &  (2017). 91ל91ם&Բ;Front Microbiol, 8, 1496. doi:10.3389/fmicb.2017.0149.

Mark Welch, D. B., Jauch, A., Langowski, J., Olins, A. L., & Olins, D. E. (2017). 91ל91ם&Բ;Nucleus, 8(2), 222-237. doi:10.1080/19491034.2017.128598.

Mark Welch, J. L., Hasegawa, Y., McNulty, N. P., Gordon, J. I., &  (2017). 91ל91ם&Բ;Proc Natl Acad Sci U S A, 114(43), E9105-E9114. doi:10.1073/pnas.171159611.

Perez, T., Rodriguez, F., Fernandez, M., Albornoz, J., & Dominguez, A. (2017). 91ל91ם&Բ;Gene, 628(Supplement C), 63-71. doi:10.1016/j.gene.2017.07.03.

Quince, C., Delmont, T. O., Raguideau, S., Alneberg, J., Darling, A. E., Collins, G., &  (2017). 91ל91ם&Բ;Genome Biol, 18(1), 181. doi:10.1186/s13059-017-1309-.

Rodriguez, F., Kenefick, A. W., & Arkhipova, I. R. (2017). 91ל91ם&Բ;Viruses, 9(4). doi:10.3390/v904007.

Schmidt, V., Gomez-Chiarri, M., Roy, C., Smith, K., & Amaral-Zettler, L. A. (2017). 91ל91ם&Բ;Msystems, 2(6). doi:UNSP e00133-17 10.1128/mSystems.00133-1.

Smith, M. W., Herfort, L., , Crump, B. C., & Simon, H. M. (2017). 91ל91ם&Բ;Microbiologyopen, 6(4). doi:10.1002/mbo3.46.

Stellato, G., Utter, D. R., Voorhis, A., De Angelis, M., , & Ercolini, D. (2017). 91ל91ם&Բ;Front Microbiol, 8, 264. doi:10.3389/fmicb.2017.0026.

Sylvan, J. B., Wankel, S. D., LaRowe, D. E., Charoenpong, C. N., , Moyer, C. L., & Edwards, K. J. (2017). 91ל91ם&Բ;Geochimica Et Cosmochimica Acta, 198, 131-150. doi:10.1016/j.gca.2016.10.02.

Teif, V. B., Mallm, J. P., Sharma, T., Mark Welch, D. B., Rippe, K., Eils, R., Langowski, J., Olins, A. L., & Olins, D. E. (2017). 91ל91ם&Բ;Nucleus, 8(2), 188-204. doi:10.1080/19491034.2017.129520.

Wilbert, S. A., Mark Welch, J. L., Dewhirst, F. E., &  (2017). 91ל91ם&Բ;Paper presented at the ASCB/EMBO Meeting, Philadelphia, PA.

Zettler, E. R., Takada, H., Monteleone, B., Mallos, N., Eriksen, M., & Amaral-Zettler, L. A. (2017). 91ל91ם&Բ;Analytical Methods, 9(9), 1392-1403. doi:10.1039/c6ay02716.

2016

Arkhipova, I. R., & Rice, P. A. (2016). 91ל91ם&Բ;Mol Ecol, 25(5), 1027-1031. doi:10.1111/mec.1354.

Balint, M., Bahram, M., , Faust, K., Fuhrman, J. A., Lindahl, B., O91יHara, R. B., Opik, M., Sogin, M. L., Unterseher, M., & Tedersoo, L. (2016). 91ל91ם&Բ;FEMS Microbiol Rev, 40(5), 686-700. doi:10.1093/femsre/fuw01.

Britstein, M., Devescovi, G., Handley, K. M., Malik, A., Haber, M., Saurav, K., Teta, R., Costantino, V., Burgsdorf, I., , Sher, N., Venturi, V., & Steindler, L. (2016). 91ל91ם&Բ;Appl Environ Microbiol, 82(4), 1274-1285. doi:10.1128/aem.03111-1.

Chernikova, D. A., Koestler, D. C., Hoen, A. G., Housman, M. L., Hibberd, P. L., Moore, J. H., Morrison, H. G., Sogin, M. L., Zain-Ul-Abideen, M., & Madan, J. C. (2016). 91ל91ם&Բ;J Matern Fetal Neonatal Med, 29(1), 99-105. doi:10.3109/14767058.2014.98774.

Davies, N., Field, D., Gavaghan, D., Holbrook, S. J., Planes, S., Troyer, M., Bonsall, M., Claudet, J., Roderick, G., Schmitt, R. J., Amaral-Zettler, L. A., Berteaux, V., Bossin, H. C., Cabasse, C., Collin, A., Deck, J., Dell, T., Dunne, J., Gates, R., Harfoot, M., Hench, J. L., Hopuare, M., Kirch, P., Kotoulas, G., Kosenkov, A., Kusenko, A., Leichter, J. J., Lenihan, H., Magoulas, A., Martinez, N., Meyer, C., Stoll, B., Swalla, B., Tartakovsky, D. M., Murphy, H. T., Turyshev, S., Valdvinos, F., Williams, R., Wood, S., & Consortium, I. (2016). 91ל91ם&Բ;Gigascience, 5(1), 14. doi:10.1186/s13742-016-0118-.

De Filippis, F., Genovese, A., Ferranti, P., , & Ercolini, D. (2016). 91ל91ם&Բ;Sci Rep, 6, 21871. doi:10.1038/srep2187.

Delmont, T. O., &  (2016). 91ל91ם&Բ;PeerJ, 4, e1839. doi:10.7717/peerj.183.

Denner, D. R., Sangwan, N., Becker, J. B., Hogarth, D. K., Oldham, J., Castillo, J., Sperling, A. I., Solway, J., Naureckas, E. T., , & White, S. R. (2016). 91ל91ם&Բ;J Allergy Clin Immunol, 137(5), 1398-1405 e1393. doi:10.1016/j.jaci.2015.10.01.

Dugas, L. R., Fuller, M., Gilbert, J., & Layden, B. T. (2016). 91ל91ם&Բ;Emerg Themes Epidemiol, 13, 2. doi:10.1186/s12982-015-0044-.

, Sogin, M. L., & Maignien, L. (2016). 91ל91ם&Բ;Frontiers in Microbiology, 7, 1318. doi:ARTN 131810.3389/fmicb.2016.0131.

Fernandez-Gonzalez, N., , & Vallino, J. J. (2016). 91ל91ם&Բ;mSystems, 1(5). doi:10.1128/mSystems.00117-1.

, &  (2016). 91ל91ם&Բ;ISME J, 10(8), 1925-1938. doi:10.1038/ismej.2015.25.

Gibbons, S. M., Scholz, M., Hutchison, A. L., Dinner, A. R., , & Coleman, M. L. (2016). 91ל91ם&Բ;MBIO, 7(6). doi:10.1128/mBio.01372-1.

 (2016). 91ל91ם&Բ;mSystems, 1(1). doi:10.1128/mSystems.00015-1.

, & Alverdy, J. (2016). 91ל91ם&Բ;Gut, 65(1), 1-2. doi:10.1136/gutjnl-2015-31004.

, Klyczek, K. K., & Elliott, S. L. (2016). 91ל91ם&Բ;J Microbiol Biol Educ, 17(1), 1-2. doi:10.1128/jmbe.v17i1.111.

Hogan, D. A., Willger, S. D., Dolben, E. L., Hampton, T. H., Stanton, B. A., Morrison, H. G., Sogin, M. L., Czum, J., & Ashare, A. (2016). 91ל91ם&Բ;PLoS One, 11(3), e0149998. doi:10.1371/journal.pone.014999.

Kaneko, G., Yoshinaga, T., Gribble, K. E., Mark Welch, D. B., & Ushio, H. (2016). 91ל91ם&Բ;J Vis Exp(113), e54126. doi:10.3791/5412.

Kleindienst, S., Grim, S., Sogin, M., Bracco, A., Crespo-Medina, M., & Joye, S. B. (2016). 91ל91ם&Բ;ISME J, 10(2), 400-415. doi:10.1038/ismej.2015.12.

Kleindienst, S., Seidel, M., Ziervogel, K., Grim, S., Loftis, K., Harrison, S., Malkin, S. Y., Perkins, M. J., Field, J., Sogin, M. L., Dittmar, T., Passow, U., Medeiros, P., & Joye, S. B. (2016). 91ל91ם&Բ;Proc Natl Acad Sci U S A, 113(11), E1422-1423. doi:10.1073/pnas.160049811.

Li, H., Yang, X., Weng, B., Su, J., Nie, S., , & Zhu, Y. G. (2016). 91ל91ם&Բ;SOIL BIOLOGY & BIOCHEMISTRY, 100, 59-65. doi:10.1016/j.soilbio.2016.05.01.

Liebeskind, B. J., Hillis, D. M., Zakon, H. H., & Hofmann, H. A. (2016). 91ל91ם&Բ;Trends Ecol Evol, 31(2), 127-135. doi:10.1016/j.tree.2015.12.00.

Luria, C. M., Amaral-Zettler, L. A., Ducklow, H. W., & Rich, J. J. (2016). 91ל91ם&Բ;Front Microbiol, 7(ARTN 1731), 1731. doi:10.3389/fmicb.2016.0173.

Madan, J. C., Hoen, A. G., Lundgren, S. N., Farzan, S. F., Cottingham, K. L., Morrison, H. G., Sogin, M. L., Li, H., Moore, J. H., & Karagas, M. R. (2016). 91ל91ם&Բ;JAMA PEDIATRICS, 170(3), 212-219. doi:10.1001/jamapediatrics.2015.373.

Mark Welch, J. L., Rossetti, B. J., Rieken, C. W., Dewhirst, F. E., &  (2016). 91ל91ם&Բ;Proc Natl Acad Sci U S A, 113(6), E791-800. doi:10.1073/pnas.152214911.

Metcalf, J. L., Xu, Z. Z., Weiss, S., Lax, S., Van Treuren, W., Hyde, E. R., Song, S. J., Amir, A., Larsen, P., Sangwan, N., Haarmann, D., Humphrey, G. C., Ackermann, G., Thompson, L. R., Lauber, C., Bibat, A., Nicholas, C., Gebert, M. J., Petrosino, J. F., Reed, S. C., , Lynne, A. M., Bucheli, S. R., Carter, D. O., & Knight, R. (2016). 91ל91ם&Բ;Science, 351(6269), 158-162. doi:10.1126/science.aad264.

Meyer, J. L., Jaekel, U., Tully, B. J., Glazer, B. T., Wheat, C. G., Lin, H. T., Hsieh, C. C., Cowen, J. P., Hulme, S. M., Girguis, P. R., &  (2016). 91ל91ם&Բ;Sci Rep, 6, 22541. doi:10.1038/srep2254.

Mills, S., Alcántara-Rodríguez, J. A., Ciros-Pérez, J., Gómez, A., Hagiwara, A., Galindo, K. H., Jersabek, C. D., Malekzadeh-Viayeh, R., Leasi, F., Lee, J.-S., Mark Welch, D. B., Papakostas, S., Riss, S., Segers, H., Serra, M., Shiel, R., Smolak, R., Snell, T. W., Stelzer, C.-P., Tang, C. Q., Wallace, R. L., Fontaneto, D., & Walsh, E. J. (2016). 91ל91ם&Բ;Hydrobiologia, 796(1), 39-58. doi:10.1007/s10750-016-2725-.

O91יBrien, S. L., Gibbons, S. M., Owens, S. M., Hampton-Marcell, J., Johnston, E. R., Jastrow, J. D., , Meyer, F., & Antonopoulos, D. A. (2016). 91ל91ם&Բ;Environ Microbiol, 18(6), 2039-2051. doi:10.1111/1462-2920.1323.

Perisin, M., Vetter, M., , & Bergelson, J. (2016). 91ל91ם&Բ;ISME J, 10(4), 1020-1024. doi:10.1038/ismej.2015.16.

, , McDermott, J., Algar, C., Meyer, J. L., Sylva, S., Seewald, J., German, C. R., &  (2016). 91ל91ם&Բ;Environ Microbiol, 18(6), 1970-1987. doi:10.1111/1462-2920.1317.

Rochman, C. M., Browne, M. A., Underwood, A. J., van Franeker, J. A., Hompson, R. C. T., & Amaral-Zettler, L. A. (2016). 91ל91ם&Բ;Ecology, 97(2), 302-312. doi:10.1890/14-2070..

Rodriguez, F., & Arkhipova, I. R. (2016). 91ל91ם&Բ;Genetics, 203(1), 255-268. doi:10.1534/genetics.116.18673.

Sangwan, N., Xia, F., &  (2016). 91ל91ם&Բ;Microbiome, 4(1), 8. doi:10.1186/s40168-016-0154-.

Schmidt, V., Amaral-Zettler, L. A., Davidson, J., Summerfelt, S., & Good, C. (2016). 91ל91ם&Բ;Appl Environ Microbiol, 82(15), 4470-4481. doi:10.1128/AEM.00902-1.

Sharma, A., , & Lal, R. (2016). 91ל91ם&Բ;Scientific Reports, 6, 25527. doi:ARTN 25527 10.1038/srep2552.

Sielaff, M., Schmidt, H., Struck, T. H., Rosenkranz, D., Mark Welch, D. B., Hankeln, T., & Herlyn, H. (2016). 91ל91ם&Բ;Rotifera): Mitochondrial gene order verifies epizoic Seisonidea as sister to endoparasitic Acanthocephala within monophyletic Hemirotifera. Mol Phylogenet Evol, 96, 79-92. doi:10.1016/j.ympev.2015.11.01.

Sun, R., Dsouza, M., , Guo, X., Wang, D., Guo, Z., Ni, Y., & Chu, H. (2016). 91ל91ם&Բ;Environ Microbiol, 18(12), 5137-5150. doi:10.1111/1462-2920.1351.

Topcuoglu, B. D., Stewart, L. C., Morrison, H. G., Butterfield, D. A., , & Holden, J. F. (2016). 91ל91ם&Բ;Frontiers in Microbiology, 7(ARTN 1240). doi:10.3389/fmicb.2016.0124.

Utter, D. R., Welch, J. L. M., &  (2016). 91ל91ם&Բ;FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 7(ARTN 564). doi:10.3389/fmicb.2016.0056.

Vineis, J. H., Ringus, D. L., Morrison, H. G., Delmont, T. O., Dalal, S., Raffals, L. H., Antonopoulos, D. A., Rubin, D. T., , Chang, E. B., & Sogin, M. L. (2016). 91ל91ם&Բ;MBio, 7(6), e01713-01716. doi:10.1128/mBio.01713-1.

Walsh, E. A., Kirkpatrick, J. B., Pockalny, R., Sauvage, J., Spivack, A. J., Murray, R. W., Sogin, M. L., & D91יHondt, S. (2016). 91ל91ם&Բ;Appl Environ Microbiol, 82(16), 4994-4999. doi:10.1128/AEM.00809-1.

Walsh, E. A., Kirkpatrick, J. B., Rutherford, S. D., Smith, D. C., Sogin, M., & D91יHondt, S. (2016). 91ל91ם&Բ;ISME J, 10(4), 979-989. doi:10.1038/ismej.2015.17.

Walters, W., Hyde, E. R., Berg-Lyons, D., Ackermann, G., Humphrey, G., Parada, A., , Jansson, J. K., Caporaso, J. G., Fuhrman, J. A., Apprill, A., & Knight, R. (2016). 91ל91ם&Բ;mSystems, 1(1). doi:10.1128/mSystems.00009-1.

Ward, M. A., Pierre, J. F., Leal, R. F., Huang, Y., Shogan, B., Dalal, S. R., Weber, C. R., Leone, V. A., Musch, M. W., An, G. C., Rao, M. C., Rubin, D. T., Raffals, L. E., Antonopoulos, D. A., Sogin, M. L., Hyman, N. H., Alverdy, J. C., & Chang, E. B. (2016). 91ל91ם&Բ;Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol, 310(11), G973-988. doi:10.1152/ajpgi.00017.201.

Wardrip, N. C., Dsouza, M., Urgun-Demirtas, M., Snyder, S. W., , & Arnusch, C. J. (2016). 91ל91ם&Բ;ACS APPLIED MATERIALS & INTERFACES, 8(44), 30271-30280. doi:10.1021/acsami.6b1133.

Yang, T., Weisenhorn, P., , Ni, Y., Sun, R., Shi, Y., & Chu, H. (2016). 91ל91ם&Բ;Environ Microbiol, 18(8), 2455-2469. doi:10.1111/1462-2920.1315.

Zheng, Y., Huang, Y., Andersen, R. A., & Amaral-Zettler, L. A. (2016). 91ל91ם&Բ;Geochimica et Cosmochimica Acta, 175, 36-46. doi:10.1016/j.gca.2015.11.02.

Zozaya, M., Ferris, M. J., Siren, J. D., Lillis, R., Myers, L., Nsuami, M. J., , Brown, J., Taylor, C. M., & Martin, D. H. (2016). 91ל91ם&Բ;Microbiome, 4(1), 16. doi:10.1186/s40168-016-0161-.

2015

Alivisatos, A. P., Blaser, M. J., Brodie, E. L., Chun, M., Dangl, J. L., Donohue, T. J., Dorrestein, P. C., , Green, J. L., Jansson, J. K., Knight, R., Maxon, M. E., McFall-Ngai, M. J., Miller, J. F., Pollard, K. S., Ruby, E. G., & Taha, S. A. (2015). 91ל91ם&Բ;Science, 350. doi:10.1126/science.aac848.

Amaral-Zettler, L. A., Zettler, E. R., Slikas, B., Boyd, G. D., Melvin, D. W., Morrall, C. E., Proskurowski, G., & Mincer, T. J. (2015). 91ל91ם&Բ;Frontiers in Ecology and the Environment, 13(10), 541-546. doi:10.1890/15001.

Amata, E., Bland, N. D., Campbell, R. K., & Pollastri, M. P. (2015). 91ל91ם&Բ;Tetrahedron Lett, 56(21), 2832-2835. doi:10.1016/j.tetlet.2015.04.06.

Anderson, R. E., Sogin, M. L., & Baross, J. A. (2015). 91ל91ם&Բ;FEMS Microbiol Ecol, 91(1), 1-11. doi:10.1093/femsec/fiu01.

Angermeyer, A., Crosby, S. C., &  (2015). 91ל91ם&Բ;Environ Microbiol, 18(1), 75-86. doi:10.1111/1462-2920.1282.

Bertrand, E. M., McCrow, J. P., Moustafa, A., Zheng, H., McQuaid, J. B., Delmont, T. O., Post, A. F., Sipler, R. E., Spackeen, J. L., Xu, K., Bronk, D. A., Hutchins, D. A., & Allen, A. E. (2015). 91ל91ם&Բ;Proc Natl Acad Sci U S A, 112(32), 9938-9943. doi:10.1073/pnas.150161511.

Bowen, J. L., Weisman, D., Yasuda, M., Jayakumar, A., Morrison, H. G., & Ward, B. B. (2015). 91ל91ם&Բ;Microb Ecol, 70(2), 311-321. doi:10.1007/s00248-015-0582-.

Browne, M. A., Chapman, M. G., Thompson, R. C., Amaral-Zettler, L. A., Jambeck, J., & Mallos, N. J. (2015). 91ל91ם&Բ;Environ Sci Technol, 49(12), 7082-7094. doi:10.1021/es506057.

Burgsdorf, I., Slaby, B. M., Handley, K. M., Haber, M., Blom, J., Marshall, C. W., , Hentschel, U., & Steindler, L. (2015). 91ל91ם&Բ;MBio, 6(3), e00391-00315. doi:10.1128/mBio.00391-1.

Chafee, M., Maignien, L., & Simmons, S. L. (2015). 91ל91ם&Բ;Environ Microbiol, 17(7), 2239-2253. doi:10.1111/1462-2920.1266.

Delmont, T. O., , Maccario, L., Prestat, E., Esen, O. C., Pelletier, E., Le Paslier, D., Simonet, P., & Vogel, T. M. (2015). 91ל91ם&Բ;Front Microbiol, 6, 358. doi:10.3389/fmicb.2015.0035.

Delmont, T. O., , Vineis, J. H., & Post, A. F. (2015). 91ל91ם&Բ;Front Microbiol, 6, 1090. doi:10.3389/fmicb.2015.0109.

Ducklow, H. W., Wilson, S. E., Post, A. F., Stammerjohn, S. E., Erickson, M., Lee, S., Lowry, K. E., Sherrell, R. M., & Yager, P. L. (2015). 91ל91ם&Բ;Elementa: Science of the Anthropocene, 3(46), 000046. doi:10.12952/journal.elementa.00004.

, Esen, O. C., Quince, C., Vineis, J. H., Morrison, H. G., Sogin, M. L., & Delmont, T. O. (2015). 91ל91ם&Բ;PeerJ, 3, e1319. doi:10.7717/peerj.131.

, Morrison, H. G., Lescault, P. J., , Vineis, J. H., & Sogin, M. L. (2015). 91ל91ם&Բ;ISME J, 9(4), 968-979. doi:10.1038/ismej.2014.19.

, Sogin, M. L., Morrison, H. G., Vineis, J. H., Fisher, J. C., Newton, R. J., & McLellan, S. L. (2015). 91ל91ם&Բ;ISME J, 9(1), 90-100. doi:10.1038/ismej.2014.9.

Filkins, L. M., Dolben, E. L., Willger, S. D., Gifford, A. H., Sogin, M. L., Morrison, H. G., Grim, S. L., Ashare, A., Schwartzman, J. D., & Hogan, D. (2015). 91לBacfun: An Rna-Based Diagnostic for Cystic Fibrosis Respiratory Samples.91ם&Բ;Pediatric Pulmonology, 50, 321-321.

Fisher, J. C., , Green, H. C., Shanks, O. C., Morrison, H. G., Vineis, J. H., Sogin, M. L., & McLellan, S. L. (2015). 91ל91ם&Բ;Appl Environ Microbiol, 81(20), 7023-7033. doi:10.1128/AEM.01524-1.

, & Crump, B. C. (2015). 91ל91ם&Բ;PLoS One, 10(11), e0140578. doi:10.1371/journal.pone.014057.

Fuller, M., Priyadarshini, M., Gibbons, S. M., Angueira, A. R., Brodsky, M., Hayes, M. G., Kovatcheva-Datchary, P., Backhed, F., , Lowe, W. L. Jr., & Layden, B. T. (2015). 91ל91ם&Բ;Am J Physiol Endocrinol Metab, 309(10), E840-851. doi:10.1152/ajpendo.00171.201.

Gibbons, S. M., &  (2015). 91ל91ם&Բ;Curr Opin Genet Dev, 35, 66-72. doi:10.1016/j.gde.2015.10.00.

Gibbons, S. M., Schwartz, T., Fouquier, J., Mitchell, M., Sangwan, N., , & Kelley, S. T. (2015). 91ל91ם&Բ;Appl Environ Microbiol, 81(2), 765-773. doi:10.1128/AEM.03117-1.

, & Henry, C. (2015). 91ל91ם&Բ;Environ Microbiol Rep, 7(1), 20-22. doi:10.1111/1758-2229.1225.

Gordon, J., Gandhi, P., Shekhawat, G., Frazier, A., Hampton-Marcell, J., &  (2015). 91ל91ם&Բ;Microbiome, 3(1), 79. doi:10.1186/s40168-015-0141-.

Green, H. C., Fisher, J. C., McLellan, S. L., Sogin, M. L., & Shanks, O. C. (2015). 91ל91ם&Բ;Appl Environ Microbiol, 82(5), 1496-1503. doi:10.1128/AEM.02456-1.

Hoen, A. G., Li, J., Moulton, L. A., O91יToole, G. A., Housman, M. L., Koestler, D. C., Guill, M. F., Moore, J. H., Hibberd, P. L., Morrison, H. G., Sogin, M. L., Karagas, M. R., & Madan, J. C. (2015). 91ל91ם&Բ;J Pediatr, 167(1), 138-147 e131-133. doi:10.1016/j.jpeds.2015.02.04.

Huang, E. Y., Inoue, T., Leone, V. A., Dalal, S., Touw, K., Wang, Y., Musch, M. W., Theriault, B., Higuchi, K., Donovan, S., , & Chang, E. B. (2015). 91ל91ם&Բ;Inflamm Bowel Dis, 21(5), 963-972. doi:10.1097/MIB.000000000000033.

 (2015). 91ל91ם&Բ;Making methane down deep. Science, 349(6246), 376-377. doi:10.1126/science.aac667.

Hunter-Cevera, K. R., Post, A. F., Peacock, E. E., & Sosik, H. M. (2015). 91ל91ם&Բ;Microb Ecol, 71(2), 276-289. doi:10.1007/s00248-015-0644-.

Huo, Y. Y., Cheng, H., Post, A. F., Wang, C. S., Jiang, X. W., Pan, J., Wu, M., & Xu, X. W. (2015). 91ל91ם&Բ;Acta Oceanologica Sinica, 34(4), 92-113. doi:10.1007/s13131-015-0650-.

Kleindienst, S., Seidel, M., Ziervogel, K., Grim, S., Loftis, K., Harrison, S., Malkin, S. Y., Perkins, M. J., Field, J., Sogin, M. L., Dittmar, T., Passow, U., Medeiros, P. M., & Joye, S. B. (2015). 91ל91ם&Բ;Proc Natl Acad Sci U S A, 112(48), 14900-14905. doi:10.1073/pnas.150738011.

Kopf, A., Bicak, M., Kottmann, R., Schnetzer, J., Kostadinov, I., Lehmann, K., Fernandez-Guerra, A., Jeanthon, C., Rahav, E., Ullrich, M., Wichels, A., Gerdts, G., Polymenakou, P., Kotoulas, G., Siam, R., Abdallah, R. Z., Sonnenschein, E. C., Cariou, T., O91יGara, F., Jackson, S., Orlic, S., Steinke, M., Busch, J., Duarte, B., Cacador, I., Canning-Clode, J., Bobrova, O., Marteinsson, V., Reynisson, E., Loureiro, C. M., Luna, G. M., Quero, G. M., Loscher, C. R., Kremp, A., DeLorenzo, M. E., Ovreas, L., Tolman, J., LaRoche, J., Penna, A., Frischer, M., Davis, T., Katherine, B., Meyer, C. P., Ramos, S., Magalhaes, C., Jude-Lemeilleur, F., Aguirre-Macedo, M. L., Wang, S., Poulton, N., Jones, S., Collin, R., Fuhrman, J. A., Conan, P., Alonso, C., Stambler, N., Goodwin, K., Yakimov, M. M., Baltar, F., Bodrossy, L., Van De Kamp, J., Frampton, D. M., Ostrowski, M., Van Ruth, P., Malthouse, P., Claus, S., Deneudt, K., Mortelmans, J., Pitois, S., Wallom, D., Salter, I., Costa, R., Schroeder, D. C., Kandil, M. M., Amaral, V., Biancalana, F., Santana, R., Pedrotti, M. L., Yoshida, T., Ogata, H., Ingleton, T., Munnik, K., Rodriguez-Ezpeleta, N., Berteaux-Lecellier, V., Wecker, P., Cancio, I., Vaulot, D., Bienhold, C., Ghazal, H., Chaouni, B., Essayeh, S., Ettamimi, S., Zaid el, H., Boukhatem, N., Bouali, A., Chahboune, R., Barrijal, S., Timinouni, M., El Otmani, F., Bennani, M., Mea, M., Todorova, N., Karamfilov, V., Ten Hoopen, P., Cochrane, G., L91יHaridon, S., Bizsel, K. C., Vezzi, A., Lauro, F. M., Martin, P., Jensen, R. M., Hinks, J., Gebbels, S., Rosselli, R., De Pascale, F., Schiavon, R., Dos Santos, A., Villar, E., Pesant, S., Cataletto, B., Malfatti, F., Edirisinghe, R., Silveira, J. A., Barbier, M., Turk, V., Tinta, T., Fuller, W. J., Salihoglu, I., Serakinci, N., Ergoren, M. C., Bresnan, E., Iriberri, J., Nyhus, P. A., Bente, E., Karlsen, H. E., Golyshin, P. N., Gasol, J. M., Moncheva, S., Dzhembekova, N., Johnson, Z., Sinigalliano, C. D., Gidley, M. L., Zingone, A., Danovaro, R., Tsiamis, G., Clark, M. S., Costa, A. C., El Bour, M., Martins, A. M., Collins, R. E., Ducluzeau, A. L., Martinez, J., Costello, M. J., Amaral-Zettler, L. A., , Davies, N., Field, D., & Glockner, F. O. (2015). 91ל91ם&Բ;Gigascience, 4, 27. doi:10.1186/s13742-015-0066-.

Larsen, P. E., Scott, N., Post, A. F., Field, D., Knight, R., Hamada, Y., &  (2015). 91ל91ם&Բ;ISME J, 9(1), 166-179. doi:10.1038/ismej.2014.10.

Lax, S., &  (2015). 91ל91ם&Բ;Trends Mol Med, 21(7), 427-432. doi:10.1016/j.molmed.2015.03.00.

Lax, S., Hampton-Marcell, J. T., Gibbons, S. M., Colares, G. B., Smith, D., Eisen, J. A., &  (2015). 91ל91ם&Բ;Microbiome, 3, 21. doi:10.1186/s40168-015-0082-.

Lax, S., Nagler, C. R., &  (2015). 91ל91ם&Բ;Trends Immunol, 36(3), 121-123. doi:10.1016/j.it.2015.01.00.

Liebeskind, B. J., Hillis, D. M., & Zakon, H. H. (2015). 91ל91ם&Բ;Proc Natl Acad Sci U S A, 112(8), E846-851. doi:10.1073/pnas.150119511.

Lin, X., Handley, K. M., , & Kostka, J. E. (2015). 91ל91ם&Բ;ISME J, 9(12), 2740-2744. doi:10.1038/ismej.2015.7.

Lüchmann, K. H., Clark, M. S., Bainy, A. C., , Craft, J. A., Chipman, J. K., Thorne, M. A., Mattos, J. J., Siebert, M. N., & Schroeder, D. C. (2015). 91ל91ם&Բ;Aquat Toxicol, 166, 10-20. doi:10.1016/j.aquatox.2015.06.01.

Mackey, K. R. M., Chien, C. T., Post, A. F., Saito, M. A., & Paytan, A. (2015). 91ל91ם&Բ;Front Microbiol, 5, 794. doi:10.3389/fmicb.2014.0079.

Mackey, K. R. M., Post, A. F., McIlvin, M. R., Cutter, G. A., John, S. G., & Saito, M. A. (2015). 91ל91ם&Բ;Proc Natl Acad Sci U S A, 112(32), 9944-9949. doi:10.1073/pnas.150944811.

Moran, Y., Barzilai, M. G., Liebeskind, B. J., & Zakon, H. H. (2015). 91ל91ם&Բ;J Exp Biol, 218(Pt 4), 515-525. doi:10.1242/jeb.11027.

Newton, R. J., McLellan, S. L., Dila, D. K., Vineis, J. H., Morrison, H. G., , & Sogin, M. L. (2015). 91ל91ם&Բ;MBio, 6(2), e02574. doi:10.1128/mBio.02574-1.

Ochiana, S. O., Bland, N. D., Settimo, L., Campbell, R. K., & Pollastri, M. P. (2015). 91ל91ם&Բ;Evaluation of analogs of the human PDE4 inhibitor GSK-256066 as inhibitors of PDEB1 of Trypanosoma brucei. Chem Biol Drug Des, 85(5), 549-564. doi:10.1111/cbdd.1244.

Quince, C., Ijaz, U. Z., Loman, N., , Saulnier, D., Russell, J., Haig, S. J., Calus, S. T., Quick, J., Barclay, A., Bertz, M., Blaut, M., Hansen, R., McGrogan, P., Russell, R. K., Edwards, C. A., & Gerasimidis, K. (2015). 91ל91ם&Բ;Am J Gastroenterol, 110(12), 1718-1729. doi:10.1038/ajg.2015.35.

Saito, M. A., Dorsk, A., Post, A. F., McIlvin, M. R., Rappe, M. S., DiTullio, G. R., & Moran, D. M. (2015). 91ל91ם&Բ;Proteomics, 15(20), 3521-3531. doi:10.1002/pmic.20140063.

Satinsky, B. M., , Doherty, M., Smith, C. B., Sharma, S., Ward, N. D., Krusche, A. V., Yager, P. L., Richey, J. E., Moran, M. A., & Crump, B. C. (2015). 91ל91ם&Բ;Microbiome, 3(1), 39. doi:10.1186/s40168-015-0099-.

Schmidt, V. T., Smith, K. F., Melvin, D. W., & Amaral-Zettler, L. A. (2015). 91ל91ם&Բ;Mol Ecol, 24(10), 2537-2550. doi:10.1111/mec.1317.

Shade, A., &  (2015). 91ל91ם&Բ;Trends Microbiol, 23(6), 335-340. doi:10.1016/j.tim.2015.01.00.

Sielaff, M., Schmidt, H., Struck, T. H., Rosenkranz, D., Mark Welch, D. B., Hankeln, T., & Herlyn, H. (2015). 91ל91ם&Բ;Rotifera): Mitochondrial gene order verifies epizoic Seisonidea as sister to endoparasitic Acanthocephala within monophyletic Hemirotifera. Mol Phylogenet Evol, 96, 79-92. doi:10.1016/j.ympev.2015.11.01.

Signorovitch, A., Hur, J., Gladyshev, E., &  (2015). 91ל91ם&Բ;Genetics, 200(2), 581-590. doi:10.1534/genetics.115.17671.

Snell, T. W., Johnston, R. K., Gribble, K. E., & Mark Welch, D. B. (2015). 91ל91ם&Բ;Invertebr Reprod Dev, 59(1), 5-10. doi:10.1080/07924259.2014.92551.

Traeger, L. L., Volkening, J. D., Moffett, H., Gallant, J. R., Chen, P. H., Novina, C. D., Phillips, G. N. Jr., Anand, R., Wells, G. B., Pinch, M., Guth, R., Unguez, G. A., Albert, J. S., Zakon, H., Sussman, M. R., & Samanta, M. P. (2015). 91ל91ם&Բ;BMC Genomics, 16, 243. doi:10.1186/s12864-015-1288-.

Van Bonn, W., LaPointe, A., Gibbons, S. M., Frazier, A., Hampton-Marcell, J., &  (2015). 91ל91ם&Բ;Zoo Biol, 34(4), 360-367. doi:10.1002/zoo.2122.

Walsh, E. A., Smith, D. C., Sogin, M. L., & D91יHondt, S. (2015). 91ל91ם&Բ;Aquatic Microbial Ecology, 75(1), 1-13. doi:10.3354/ame0174.

Wood, M., Gibbons, S. M., Lax, S., Eshoo-Anton, T. W., Owens, S. M., Kennedy, S., , & Hampton-Marcell, J. T. (2015). 91ל91ם&Բ;Microbiome, 3, 25. doi:10.1186/s40168-015-0088-.

Ying, S., Zeng, D. N., Chi, L., Tan, Y., Galzote, C., Cardona, C., Lax, S., Gilbert, J., & Quan, Z. X. (2015). 91ל91ם&Բ;PLoS One, 10(10), e0141842. doi:10.1371/journal.pone.014184.

Zarraonaindia, I., Owens, S. M., Weisenhorn, P., West, K., Hampton-Marcell, J., Lax, S., Bokulich, N. A., Mills, D. A., Martin, G., Taghavi, S., van der Lelie, D., &  (2015). 91ל91ם&Բ;MBio, 6(2). doi:10.1128/mBio.02527-1.

2014

Amata, E., Bland, N. D., Hoyt, C. T., Settimo, L., Campbell, R. K., & Pollastri, M. P. (2014). 91ל91ם&Բ;Bioorg Med Chem Lett, 24(17), 4084-4089. doi:10.1016/j.bmcl.2014.07.06.

Anderson, R. E., Sogin, M. L., & Baross, J. A. (2014). 91ל91ם&Բ;PLoS One, 9(10), e109696. doi:10.1371/journal.pone.010969.

Apprill, A., Robbins, J., , Pack, A. A., , Mattila, D., Moore, M., Niemeyer, M., Moore, K. M., & Mincer, T. J. (2014). 91ל91ם&Բ;PLoS One, 9(3), e90785. doi:10.1371/journal.pone.009078.

Beliaev, A. S., Romine, M. F., , Bernstein, H. C., Linggi, B. E., Markillie, L. M., Isern, N. G., Chrisler, W. B., Kucek, L. A., Hill, E. A., Pinchuk, G. E., Bryant, D. A., Wiley, H. S., Fredrickson, J. K., & Konopka, A. (2014). 91ל91ם&Բ;ISME J, 8(11), 2243-2255. doi:10.1038/ismej.2014.6.

Bullerjahn, G. S., & Post, A. F. (2014). 91ל91ם&Բ;Front Microbiol, 5, 359. doi:10.3389/fmicb.2014.0035.

Celaj, S., Gleeson, M. W., Deng, J., O91יToole, G. A., Hampton, T. H., Toft, M. F., Morrison, H. G., Sogin, M. L., Putra, J., Suriawinata, A. A., & Gorham, J. D. (2014). 91ל91ם&Բ;Lab Invest, 94(9), 938-949. doi:10.1038/labinvest.2014.9.

Cusack, D. F., Axsen, J., Shwom, R., Hartzell-Nichols, L., White, S., & Mackey, K. R. M. (2014). 91ל91ם&Բ;Frontiers in Ecology and the Environment, 12(5), 280-287. doi:10.1890/13003.

Davies, N., Field, D., Amaral-Zettler, L. A., Bicak, M., Bourlat, S., Coddington, J., Deck, J., Drummond, A., , Glöckner, F. O., Kottmann, R., Meyer, C., Morrison, N., Obst, M., Robbins, R., Schriml, L., Sterk, P., & Stones-Havas, S. (2014). 91ל91ם&Բ;Standards in Genomic Sciences; Vol 9, No 3 (2014): Standards in Genomic Sciences.

Davies, N., Field, D., Amaral-Zettler, L. A., Clark, M. S., Deck, J., Drummond, A., Faith, D. P., Geller, J., Gilbert, J., Glockner, F. O., Hirsch, P. R., Leong, J. A., Meyer, C., Obst, M., Planes, S., Scholin, C., Vogler, A. P., Gates, R. D., Toonen, R., Berteaux-Lecellier, V., Barbier, M., Barker, K., Bertilsson, S., Bicak, M., Bietz, M. J., Bobe, J., Bodrossy, L., Borja, A., Coddington, J., Fuhrman, J., Gerdts, G., Gillespie, R., Goodwin, K., Hanson, P. C., Hero, J. M., Hoekman, D., Jansson, J., Jeanthon, C., Kao, R., Klindworth, A., Knight, R., Kottmann, R., Koo, M. S., Kotoulas, G., Lowe, A. J., Marteinsson, V. T., Meyer, F., Morrison, N., Myrold, D. D., Pafilis, E., Parker, S., Parnell, J. J., Polymenakou, P. N., Ratnasingham, S., Roderick, G. K., Rodriguez-Ezpeleta, N., Schonrogge, K., Simon, N., Valette-Silver, N. J., Springer, Y. P., Stone, G. N., Stones-Havas, S., Sansone, S. A., Thibault, K. M., Wecker, P., Wichels, A., Wooley, J. C., Yahara, T., Zingone, A., & COS, G. O. (2014). 91ל91ם&Բ;Gigascience, 3(1), 2. doi:10.1186/2047-217X-3-.

Dejea, C. M., Wick, E. C., Hechenbleikner, E. M., White, J. R., Mark Welch, J. L., Rossetti, B. J., Peterson, S. N., Snesrud, E. C., , Lazarev, M., Stein, E., Vadivelu, J., Roslani, A. C., Malik, A. A., Wanyiri, J. W., Goh, K. L., Thevambiga, I., Fu, K., Wan, F., Llosa, N., Housseau, F., Romans, K., Wu, X., McAllister, F. M., Wu, S., Vogelstein, B., Kinzler, K. W., Pardoll, D. M., & Sears, C. L. (2014). 91ל91ם&Բ;Proc Natl Acad Sci U S A, 111(51), 18321-18326. doi:10.1073/pnas.140619911.

Delmont, T. O., Francioli, D., Jacquesson, S., Laoudi, S., Mathieu, A., Nesme, J., Ceccherini, M. T., Nannipieri, P., Simonet, P., & Vogel, T. M. (2014). 91ל91ם&Բ;Biology and Fertility of Soils, 50(7), 1069-1076. doi:10.1007/s00374-014-0925-.

Delmont, T. O., Hammar, K. M., Ducklow, H. W., Yager, P. L., & Post, A. F. (2014). 91ל91ם&Բ;Front Microbiol, 5, 646. doi:10.3389/fmicb.2014.0064.

Durham, B. P., Grote, J., Whittaker, K. A., Bender, S. J., Luo, H., Grim, S. L., Brown, J. M., Casey, J. R., Dron, A., Florez-Leiva, L., Krupke, A., Luria, C. M., Mine, A. H., Nigro, O. D., Pather, S., Talarmin, A., Wear, E. K., Weber, T. S., Wilson, J. M., Church, M. J., DeLong, E. F., Karl, D. M., Steward, G. F., Eppley, J. M., Kyrpides, N. C., Schuster, S., & Rappe, M. S. (2014). 91ל91ם&Բ;Stand Genomic Sci, 9(3), 632-645. doi:10.4056/sigs.499898.

, , Huse, S. M., & Mark Welch, J. L. (2014). 91ל91ם&Բ;Proc Natl Acad Sci U S A, 111(28), E2875-2884. doi:10.1073/pnas.140964411.

, Morrison, H. G., Huse, S. M., & Sogin, M. L. (2014). 91ל91ם&Բ;Brief Bioinform, 15(5), 783-787. doi:10.1093/bib/bbt01.

Ferreira, A. J., Siam, R., Setubal, J. C., Moustafa, A., Sayed, A., Chambergo, F. S., Dawe, A. S., Ghazy, M. A., Sharaf, H., Ouf, A., Alam, I., Abdel-Haleem, A. M., Lehvaslaiho, H., Ramadan, E., Antunes, A., Stingl, U., Archer, J. A., Jankovic, B. R., Sogin, M. L., Bajic, V. B., & El-Dorry, H. (2014). 91ל91ם&Բ;PLoS One, 9(6), e97338. doi:10.1371/journal.pone.009733.

Field, D., Sterk, P., Kottmann, R., De Smet, J. W., Amaral-Zettler, L. A., Cochrane, G., Cole, J. R., Davies, N., Dawyndt, P., Garrity, G. M., , Glockner, F. O., Hirschman, L., Klenk, H. P., Knight, R., Kyrpides, N., Meyer, F., Karsch-Mizrachi, I., Morrison, N., Robbins, R., San Gil, I., Sansone, S., Schriml, L., Tatusova, T., Ussery, D., Yilmaz, P., White, O., Wooley, J., & Caporaso, G. (2014). 91ל91ם&Բ;Stand Genomic Sci, 9(3), 599-601. doi:10.4056/sigs.555968.

Fischer, A. H., Mozzherin, D., , Lans, K. D., Wilson, N., Cosentino, C., &  (2014). 91ל91ם&Բ;Integr Comp Biol, 54(2), 250-263. doi:10.1093/icb/icu06.

Gallant, J. R., Traeger, L. L., Volkening, J. D., Moffett, H., Chen, P. H., Novina, C. D., Phillips, G. N. Jr., Anand, R., Wells, G. B., Pinch, M., Guth, R., Unguez, G. A., Albert, J. S., Zakon, H. H., Samanta, M. P., & Sussman, M. R. (2014). 91ל91ם&Բ;Genomic basis for the convergent evolution of electric organs. Science, 344(6191), 1522-1525. doi:10.1126/science.125443.

Ghezzi, A., Liebeskind, B. J., Thompson, A., Atkinson, N. S., & Zakon, H. H. (2014). 91ל91ם&Բ;Front Mol Neurosci, 7, 15. doi:10.3389/fnmol.2014.0001.

Gifford, A. H., Alexandru, D. M., Li, Z., Dorman, D. B., Moulton, L. A., Price, K. E., Hampton, T. H., Sogin, M. L., Zuckerman, J. B., Parker, H. W., Stanton, B. A., & O91יToole, G. A. (2014). 91ל91ם&Բ;J Cyst Fibros, 13(3), 311-318. doi:10.1016/j.jcf.2013.11.00.

, Dick, G. J., Jenkins, B., Heidelberg, J., Allen, E., Mackey, K. R., & DeLong, E. F. (2014). 91ל91ם&Բ;Stand Genomic Sci, 9(3), 1252-1258. doi:10.4056/sigs.574994.

, Jansson, J. K., & Knight, R. (2014). 91ל91ם&Բ;BMC Biol, 12. doi:10.1186/s12915-014-0069-.

, & Neufeld, J. D. (2014). 91ל91ם&Բ;PLoS Biol, 12(12), e1002020. doi:10.1371/journal.pbio.100202.

Glass, E. M., Dribinsky, Y., Yilmaz, P., Levin, H., Van Pelt, R., Wendel, D., Wilke, A., Eisen, J. A., Huse, S. M., Shipanova, A., Sogin, M. L., Stajich, J., Knight, R., Meyer, F., & Schriml, L. M. (2014). 91ל91ם&Բ;ISME J, 8(1), 1-3. doi:10.1038/ismej.2013.17.

Gribble, K. E., Jarvis, G., Bock, M., & Mark Welch, D. B. (2014). 91ל91ם&Բ;Aging Cell, 13(4), 623-630. doi:10.1111/acel.1221.

Gribble, K. E., Kaido, O., Jarvis, G., & Mark Welch, D. B. (2014). 91ל91ם&Բ;Exp Gerontol, 51, 28-37. doi:10.1016/j.exger.2013.12.00.

Halliday, E., McLellan, S. L., Amaral-Zettler, L. A., Sogin, M. L., & Gast, R. J. (2014). 91ל91ם&Բ;PLoS One, 9(3), e90815. doi:10.1371/journal.pone.009081.

Hampton, T. H., Green, D. M., Cutting, G. R., Morrison, H. G., Sogin, M. L., Gifford, A. H., Stanton, B. A., & O91יToole, G. A. (2014). 91ל91ם&Բ;Microbiome, 2, 14. doi:10.1186/2049-2618-2-1.

Huo, Y. Y., Li, Z. Y., You, H., Wang, C. S., Post, A. F., Oren, A., & Xu, X. W. (2014). 91ל91ם&Բ;nov. and Oceanicola flagellatus sp. nov., moderately halophilic bacteria isolated from seawater. Int J Syst Evol Microbiol, 64(Pt 9), 2975-2979. doi:10.1099/ijs.0.062588-.

Huse, S. M., Mark Welch, D. B., Voorhis, A., Shipunova, A., Morrison, H. G., , & Sogin, M. L. (2014). 91ל91ם&Բ;BMC Bioinformatics, 15(1), 41. doi:10.1186/1471-2105-15-4.

Huse, S. M., Young, V. B., Morrison, H. G., Antonopoulos, D. A., Kwon, J., Dalal, S., Arrieta, R., Hubert, N. A., Shen, L., Vineis, J. H., Koval, J. C., Sogin, M. L., Chang, E. B., & Raffals, L. E. (2014). 91ל91ם&Բ;Microbiome, 2(1), 5. doi:10.1186/2049-2618-2-.

Keeling, P. J., Burki, F., Wilcox, H. M., Allam, B., Allen, E. E., Amaral-Zettler, L. A., Armbrust, E. V., Archibald, J. M., Bharti, A. K., Bell, C. J., Beszteri, B., Bidle, K. D., Cameron, C. T., Campbell, L., Caron, D. A., Cattolico, R. A., Collier, J. L., Coyne, K., Davy, S. K., Deschamps, P., Dyhrman, S. T., Edvardsen, B., Gates, R. D., Gobler, C. J., Greenwood, S. J., Guida, S. M., Jacobi, J. L., Jakobsen, K. S., James, E. R., Jenkins, B., John, U., Johnson, M. D., Juhl, A. R., Kamp, A., Katz, L. A., Kiene, R., Kudryavtsev, A., Leander, B. S., Lin, S., Lovejoy, C., Lynn, D., Marchetti, A., McManus, G., Nedelcu, A. M., Menden-Deuer, S., Miceli, C., Mock, T., Montresor, M., Moran, M. A., Murray, S., Nadathur, G., Nagai, S., Ngam, P. B., Palenik, B., Pawlowski, J., Petroni, G., Piganeau, G., Posewitz, M. C., Rengefors, K., Romano, G., Rumpho, M. E., Rynearson, T., Schilling, K. B., Schroeder, D. C., Simpson, A. G., Slamovits, C. H., Smith, D. R., Smith, G. J., Smith, S. R., Sosik, H. M., Stief, P., Theriot, E., Twary, S. N., Umale, P. E., Vaulot, D., Wawrik, B., Wheeler, G. L., Wilson, W. H., Xu, Y., Zingone, A., & Worden, A. Z. (2014). 91ל91ם&Բ;PLoS Biol, 12(6), e1001889. doi:10.1371/journal.pbio.100188.

Koskey, A. M., Fisher, J. C., , Ponce-Terashima, R., Reis, M. G., Blanton, R. E., & McLellan, S. L. (2014). 91ל91ם&Բ;Environ Microbiol Rep, 6(6), 696-704. doi:10.1111/1758-2229.1218.

Kyrpides, N. C., Hugenholtz, P., Eisen, J. A., Woyke, T., Goker, M., Parker, C. T., Amann, R., Beck, B. J., Chain, P. S., Chun, J., Colwell, R. R., Danchin, A., Dawyndt, P., Dedeurwaerdere, T., DeLong, E. F., Detter, J. C., De Vos, P., Donohue, T. J., Dong, X. Z., Ehrlich, D. S., Fraser, C., Gibbs, R., , Gilna, P., Glockner, F. O., Jansson, J. K., Keasling, J. D., Knight, R., Labeda, D., Lapidus, A., Lee, J. S., Li, W. J., Ma, J., Markowitz, V., Moore, E. R., Morrison, M., Meyer, F., Nelson, K. E., Ohkuma, M., Ouzounis, C. A., Pace, N., Parkhill, J., Qin, N., Rossello-Mora, R., Sikorski, J., Smith, D., Sogin, M. L., Stevens, R., Stingl, U., Suzuki, K., Taylor, D., Tiedje, J. M., Tindall, B., Wagner, M., Weinstock, G., Weissenbach, J., White, O., Wang, J., Zhang, L., Zhou, Y. G., Field, D., Whitman, W. B., Garrity, G. M., & Klenk, H. P. (2014). 91ל91ם&Բ;PLoS Biol, 12(8), e1001920. doi:10.1371/journal.pbio.100192.

LaBelle, E. V., Marshall, C. W., , & May, H. D. (2014). 91ל91ם&Բ;PLoS One, 9(10), e109935. doi:10.1371/journal.pone.010993.

Lau, M. C., Cameron, C., Magnabosco, C., Brown, C. T., Schilkey, F., Grim, S., Hendrickson, S., Pullin, M., Sherwood Lollar, B., van Heerden, E., Kieft, T. L., & Onstott, T. C. (2014). 91ל91ם&Բ;Front Microbiol, 5, 531. doi:10.3389/fmicb.2014.0053.

Lie, A. A., Liu, Z., Hu, S. K., Jones, A. C., Kim, D. Y., Countway, P. D., Amaral-Zettler, L. A., Cary, S. C., Sherr, E. B., Sherr, B. F., Gast, R. J., & Caron, D. A. (2014). 91ל91ם&Բ;Appl Environ Microbiol, 80(14), 4363-4373. doi:10.1128/AEM.00057-1.

Luria, C. M., Ducklow, H. W., & Amaral-Zettler, L. A. (2014). 91ל91ם&Բ;Aquatic Microbial Ecology, 73(2), 107-121. doi:10.3354/ame0170.

Maignien, L., DeForce, E. A., Chafee, M. E., , & Simmons, S. L. (2014). 91ל91ם&Բ;MBio, 5(1), e00682-00613. doi:10.1128/mBio.00682-1.

Maltz, M. A., Bomar, L., Lapierre, P., Morrison, H. G., McClure, E. A., Sogin, M. L., & Graf, J. (2014). 91ל91ם&Բ;Front Microbiol, 5, 151. doi:10.3389/fmicb.2014.0015.

Mark Welch, J. L., Utter, D. R., Rossetti, B. J., Mark Welch, D. B., , &  (2014). 91ל91ם&Բ;Front Microbiol, 5, 568. doi:10.3389/fmicb.2014.0056.

Markham, M. R., & Zakon, H. H. (2014). 91ל91ם&Բ;J Neurosci, 34(19), 6668-6678. doi:10.1523/JNEUROSCI.0615-14.201.

McLellan, S. L., &  (2014). 91ל91ם&Բ;Trends Microbiol, 22(12), 697-706. doi:10.1016/j.tim.2014.08.00.

Meyer, J. L., &  (2014). 91ל91ם&Բ;ISME J, 8(4), 867-880. doi:10.1038/ismej.2013.20.

Moran, Y., & Zakon, H. H. (2014). 91ל91ם&Բ;Genome Biol Evol, 6(9), 2210-2217. doi:10.1093/gbe/evu17.

Nelson, M. C., Morrison, H. G., Benjamino, J., Grim, S. L., & Graf, J. (2014). 91ל91ם&Բ;PLoS One, 9(4), e94249. doi:10.1371/journal.pone.009424.

Ong, W. K., Vu, T. T., Lovendahl, K. N., Llull, J. M., , Romine, M. F., & Reed, J. L. (2014). 91ל91ם&Բ;BMC Syst Biol, 8(1), 31. doi:10.1186/1752-0509-8-3.

Orcutt, B. N., LaRowe, D. E., Lloyd, K. G., Mills, H., Orsi, W., Reese, B. K., Sauvage, J., , & Amend, J. (2014). 91ל91ם&Բ;Scientific Drilling, 17, 61-66. doi:10.5194/sd-17-61-201.

Reed, D. C., , , & Dick, G. J. (2014). 91ל91ם&Բ;Proc Natl Acad Sci U S A, 111(5), 1879-1884. doi:10.1073/pnas.131371311.

, Maignien, L., Murat Eren, A., , Apprill, A., Sogin, M. L., & Vanreusel, A. (2014). 91ל91ם&Բ;ISME J, 8(6), 1198-1209. doi:10.1038/ismej.2013.22.

Reznikoff, W. S. (2014). 91ל91ם&Բ;Res Microbiol, 165(5), 357-358. doi:10.1016/j.resmic.2014.05.02.

Sadler, N. C., Melnicki, M. R., , Merkley, E. D., Chrisler, W. B., Hill, E. A., Romine, M. F., Kim, S., Zink, E. M., Datta, S., Smith, R. D., Beliaev, A. S., Konopka, A., & Wright, A. T. (2014). 91ל91ם&Բ;ACS Chem Biol, 9(1), 291-300. doi:10.1021/cb400769.

Saito, M. A., McIlvin, M. R., Moran, D. M., Goepfert, T. J., DiTullio, G. R., Post, A. F., & Lamborg, C. H. (2014). 91ל91ם&Բ;Science, 345(6201), 1173-1177. doi:10.1126/science.125645.

Schmidt, V. T., , Zettler, E., Mincer, T. J., Murphy, L., & Amaral-Zettler, L. A. (2014). 91ל91ם&Բ;Front Microbiol, 5, 563. doi:10.3389/fmicb.2014.0056.

Scientists, G. C. o., Bracken-Grissom, H., Collins, A. G., Collins, T., Crandall, K., Distel, D., Dunn, C., Giribet, G., Haddock, S., Knowlton, N., Martindale, M., Medina, M., Messing, C., O91יBrien, S. J., Paulay, G., Putnam, N., Ravasi, T., Rouse, G. W., Ryan, J. F., Schulze, A., Worheide, G., Adamska, M., Bailly, X., Breinholt, J., Browne, W. E., Diaz, M. C., Evans, N., Flot, J. F., Fogarty, N., Johnston, M., Kamel, B., Kawahara, A. Y., Laberge, T., Lavrov, D., Michonneau, F., Moroz, L. L., Oakley, T., Osborne, K., Pomponi, S. A., Rhodes, A., Santos, S. R., Satoh, N., Thacker, R. W., Van de Peer, Y., Voolstra, C. R., Mark Welch, D. B., Winston, J., & Zhou, X. (2014). 91ל91ם&Բ;J Hered, 105(1), 1-18. doi:10.1093/jhered/est08.

Shafquat, A., Joice, R., Simmons, S. L., & Huttenhower, C. (2014). 91ל91ם&Բ;Trends Microbiol, 22(5), 261-266. doi:10.1016/j.tim.2014.01.01.

Shilova, I. N., Robidart, J. C., James Tripp, H., Turk-Kubo, K., Wawrik, B., Post, A. F., Thompson, A. W., Ward, B., Hollibaugh, J. T., Millard, A., Ostrowski, M., Scanlan, D. J., Paerl, R. W., Stuart, R., & Zehr, J. P. (2014). 91ל91ם&Բ;ISME J, 8(7), 1476-1491. doi:10.1038/ismej.2014..

, & Cosentino, C. (2014). 91ל91ם&Բ;Paper presented at the Integrative and Comparative Biology, Austin, TX.

Swan, B. K., Chaffin, M. D., Martinez-Garcia, M., Morrison, H. G., Field, E. K., Poulton, N. J., Masland, E. D., Harris, C. C., Sczyrba, A., Chain, P. S., Koren, S., Woyke, T., & Stepanauskas, R. (2014). 91ל91ם&Բ;PLoS One, 9(4), e95380. doi:10.1371/journal.pone.009538.

Thompson, A., Vo, D., Comfort, C., & Zakon, H. H. (2014). 91ל91ם&Բ;Mol Biol Evol, 31(8), 1941-1955. doi:10.1093/molbev/msu14.

Vallino, J., Algar, C., González, N., & Huber, J. (2014). 91ל91ם&Բ;In R. C. Dewar, C. H. Lineweaver, R. K. Niven, & K. Regenauer-Lieb (Ed.), Beyond the Second Law (pp. 337-359): Springer Berlin Heidelberg.

Vick-Majors, T. J., Priscu, J. C., & Amaral-Zettler, L. A. (2014). 91ל91ם&Բ;ISME J, 8(4), 778-789. doi:10.1038/ismej.2013.19.

Wey-Fabrizius, A. R., Herlyn, H., Rieger, B., Rosenkranz, D., Witek, A., Mark Welch, D. B., Ebersberger, I., & Hankeln, T. (2014). 91ל91ם&Բ;PLoS One, 9(2), e88618. doi:10.1371/journal.pone.008861.

Wickham, S. A., Claessens, M., & Post, A. F. (2014). 91ל91ם&Բ;Journal of Plankton Research, 37(1), 258-271. doi:10.1093/plankt/fbu10.

Willger, S. D., Grim, S. L., Dolben, E. L., Shipunova, A., Hampton, T. H., Morrison, H. G., Filkins, L. M., O91יToole, G. A., Moulton, L. A., Ashare, A., Sogin, M. L., & Hogan, D. A. (2014). 91ל91ם&Բ;Microbiome, 2, 40. doi:10.1186/2049-2618-2-4.

Xu, Y., Vick-Majors, T. J., Morgan-Kiss, R., Priscu, J. C., & Amaral-Zettler, L. A. (2014). 91ל91ם&Բ;Biol Bull, 227(2), 175-190.

Zakon, H. (2014). 91ל91ם&Բ;Brain Behav Evol, 83(4), 245-246. doi:10.1159/00036103.

2013

Akerman, N. H., Butterfield, D. A., &  (2013). 91ל91ם&Բ;Front Microbiol, 4, 185. doi:10.3389/fmicb.2013.0018.

Alliegro, M. C., & Alliegro, M. A. (2013). 91ל91ם&Բ;RNA Biol, 10(3), 391-396. doi:10.4161/rna.2354.

Amend, A. S., Oliver, T. A., Amaral-Zettler, L. A., Boetius, A., Fuhrman, J. A., Horner-Devine, M. C., Huse, S. M., Welch, D. B. M., Martiny, A. C., Ramette, A., Zinger, L., Sogin, M. L., & Martiny, J. B. H. (2013). 91ל91ם&Բ;Journal of Biogeography, 40(4), 800-811. doi:10.1111/jbi.1203.

Arkhipova, I. R., & Rodriguez, F. (2013). 91ל91ם&Բ;Cytogenet Genome Res, 140(2-4), 295-311. doi:10.1159/00035206.

Arkhipova, I. R., Yushenova, I. A., & Rodriguez, F. (2013). 91ל91ם&Բ;Mob DNA, 4(1), 19. doi:10.1186/1759-8753-4-1.

Bennett, S. A., Coleman, M., , , Kinsey, J. C., McIntyre, C., Seewald, J. S., & German, C. R. (2013). 91ל91ם&Բ;Geochemistry Geophysics Geosystems, 14(2), 317-327. doi:DOI 10.1002/ggge.2006.

Duffy, J. E., Amaral-Zettler, L. A., Fautin, D. G., Paulay, G., Rynearson, T. A., Sosik, H. M., & Stachowicz, J. J. (2013). 91ל91ם&Բ;Bioscience, 63(5), 350-361. doi:DOI 10.1525/bio.2013.63.5..

, Maignien, L., , Murphy, L. G., Grim, S. L., Morrison, H. G., & Sogin, M. L. (2013). 91ל91ם&Բ;Methods Ecol Evol, 4(12). doi:10.1111/2041-210X.1211.

, Vineis, J. H., Morrison, H. G., & Sogin, M. L. (2013). 91ל91ם&Բ;PLoS One, 8(6), e66643. doi:10.1371/journal.pone.006664.

Feehery, G. R., Yigit, E., Oyola, S. O., Langhorst, B. W., Schmidt, V. T., Stewart, F. J., Dimalanta, E. T., Amaral-Zettler, L. A., Davis, T., Quail, M. A., & Pradhan, S. (2013). 91ל91ם&Բ;PLoS One, 8(10), e76096. doi:10.1371/journal.pone.007609.

, , Fredman, D., &  (2013). 91ל91ם&Բ;Integr Comp Biol, 53(5), 832-846. doi:10.1093/icb/ict09.

Flot, J. F., Hespeels, B., Li, X., Noel, B., Arkhipova, I. R., Danchin, E. G., Hejnol, A., Henrissat, B., Koszul, R., Aury, J. M., Barbe, V., Barthelemy, R. M., Bast, J., Bazykin, G. A., Chabrol, O., Couloux, A., Da Rocha, M., Da Silva, C., Gladyshev, E., Gouret, P., Hallatschek, O., Hecox-Lea, B., Labadie, K., Lejeune, B., Piskurek, O., Poulain, J., Rodriguez, F., Ryan, J. F., Vakhrusheva, O. A., Wajnberg, E., Wirth, B., Yushenova, I. A., Kellis, M., Kondrashov, A. S., Mark Welch, D. B., Pontarotti, P., Weissenbach, J., Wincker, P., Jaillon, O., & Van Doninck, K. (2013). 91ל91ם&Բ;Nature, 500(7463), 453-457. doi:10.1038/nature1232.

, Eiler, A., Herfort, L., Needoba, J. A., Peterson, T. D., & Crump, B. C. (2013). 91ל91ם&Բ;ISME J, 7(10), 1899-1911. doi:10.1038/ismej.2013.7.

Gribble, K. E., & Mark Welch, D. B. (2013). 91ל91ם&Բ;J Gerontol A Biol Sci Med Sci, 68(4), 349-358. doi:10.1093/gerona/gls17.

Gupta, R. W., Tran, L., Norori, J., Ferris, M. J., , Taylor, C. M., Dowd, S. E., & Penn, D. (2013). 91ל91ם&Բ;J Pediatr Gastroenterol Nutr, 56(4), 397-400. doi:10.1097/MPG.0b013e318282a8c.

Hanson, S. J., Schurko, A. M., Hecox-Lea, B., Mark Welch, D. B., Stelzer, C. P., & Logsdon, J. M. Jr. (2013). 91ל91ם&Բ;J Hered, 104(3), 357-370. doi:10.1093/jhered/est01.

Hanson, S. J., Stelzer, C. P., Mark Welch, D. B., & Logsdon, J. M. Jr. (2013). 91ל91ם&Բ;BMC Genomics, 14, 412. doi:10.1186/1471-2164-14-41.

Helm, R. R., Siebert, S., , , & Dunn, C. W. (2013). 91ל91ם&Բ;BMC Genomics, 14, 266. doi:10.1186/1471-2164-14-26.

Huse, S. M., Mark Welch, D. B., & Sogin, M. L. (2013). 91ל91ם&Բ;188-207). Institute of Medicine. Washington, DC: The National Academies Press.

Kamennaya, N. A., & Post, A. F. (2013). 91ל91ם&Բ;Limnology and Oceanography, 58(6), 1959-1971. doi:DOI 10.4319/lo.2013.58.6.195.

Light, J. E., Hafner, J. C., Upham, N. S., &  (2013). 91ל91ם&Բ;Journal of Mammalian Evolution, 20(2), 129-146. doi:10.1007/s10914-012-9193-2.

Liu, C. M., Hungate, B. A., Toblan, A. A. R., Serwadda, D., Ravel, J., Lester, R., Kigozi, G., Aziz, M., Galiwango, R. M., Nalugoda, F., Contente-Cuomo, T. L., Wawer, M. J., Kelm, P., Gray, R. H., & Price, L. B. (2013). 91ל91ם&Բ;MBio, 4. doi:10.1128/mBio.00076-1.

Maignien, L., Parkes, R. J., Cragg, B., Niemann, H., Knittel, K., Coulon, S., Akhmetzhanov, A., & Boon, N. (2013). 91ל91ם&Բ;FEMS Microbiol Ecol, 83(1), 214-231. doi:10.1111/j.1574-6941.2012.01466..

Marteinsson, V. T., Runarsson, A., Stefansson, A., Thorsteinsson, T., Johannesson, T., Magnusson, S. H., Reynisson, E., Einarsson, B., Wade, N., Morrison, H. G., & Gaidos, E. (2013). 91ל91ם&Բ;ISME J, 7(2), 427-437. doi:10.1038/ismej.2012.9.

Materna, S. C., Swartz, S. Z., &  (2013). 91ל91ם&Բ;Development, 140(8), 1796-1806. doi:10.1242/dev.09115.

McLellan, S. L., Newton, R. J., Vandewalle, J. L., Shanks, O. C., Huse, S. M., , & Sogin, M. L. (2013). 91ל91ם&Բ;Environ Microbiol, 15(8), 2213-2227. doi:10.1111/1462-2920.1209.

Merkel, A. Y., , Chernyh, N. A., Bonch-Osmolovskaya, E. A., & Lebedinsky, A. V. (2013). 91ל91ם&Բ;Appl Environ Microbiol, 79(3), 915-923. doi:10.1128/AEM.03034-1.

Meyer, J. L., Akerman, N. H., Proskurowski, G., &  (2013). 91לMicrobiological characterization of post-eruption 91לsnowblower91ם vents at Axial Seamount, Juan de Fuca Ridge.91ם&Բ;Front Microbiol, 4, 153. doi:10.3389/fmicb.2013.0015.

Newton, R. J., Bootsma, M. J., Morrison, H. G., Sogin, M. L., & McLellan, S. L. (2013). 91ל91ם&Բ;Microb Ecol, 65(4), 1011-1023. doi:10.1007/s00248-013-0200-.

Newton, R. J., Huse, S. M., Morrison, H. G., Peake, C. S., Sogin, M. L., & McLellan, S. L. (2013). 91ל91ם&Բ;PLoS One, 8(9), e74265. doi:10.1371/journal.pone.007426.

Price, K. E., Hampton, T. H., Gifford, A. H., Dolben, E. L., Hogan, D. A., Morrison, H. G., Sogin, M. L., & O91יToole, G. A. (2013). 91ל91ם&Բ;Microbiome, 1(1), 27. doi:10.1186/2049-2618-1-2.

Rozhkov, N. V., Schostak, N. G., Zelentsova, E. S., Yushenova, I. A., Zatsepina, O. G., & Evgen91יev, M. B. (2013). 91ל91ם&Բ;Mol Biol Evol, 30(2), 397-408. doi:10.1093/molbev/mss24.

Shanks, O. C., Newton, R. J., Kelty, C. A., Huse, S. M., Sogin, M. L., & McLellan, S. L. (2013). 91ל91ם&Բ;Appl Environ Microbiol, 79(9), 2906-2913. doi:10.1128/AEM.03448-1.

, Oliver, T. A., Ducklow, H. W., Amaral-Zettler, L. A., & Sogin, M. L. (2013). 91ל91ם&Բ;Proc Natl Acad Sci U S A, 110(6), 2342-2347. doi:10.1073/pnas.121242411.

Taylor, R. C., Webb Robertson, B. J., Markillie, L. M., , Linggi, B. E., Aldrich, J. T., Hill, E. A., Romine, M. F., Lipton, M. S., & Wiley, H. S. (2013). 91ל91ם&Բ;Integr Biol (Camb), 5(11), 1393-1406. doi:10.1039/c3ib40120.

Theroux, S., Toney, J., Amaral-Zettler, L. A., & Huang, Y. S. (2013). 91ל91ם&Բ;Organic Geochemistry, 62, 68-73. doi:DOI 10.1016/j.orggeochem.2013.07.00.

, Aguiar, D., Istrail, S., &  (2013). 91ל91ם&Բ;Evodevo, 4(1), 16. doi:10.1186/2041-9139-4-1.

Ver Eecke, H. C., Akerman, N. H., , Butterfield, D. A., & Holden, J. F. (2013). 91ל91ם&Բ;Environ Microbiol Rep, 5(5), 665-671. doi:10.1111/1758-2229.1206.

Vital, M., Penton, C. R., Wang, Q., Young, V. B., Antonopoulos, D. A., Sogin, M. L., Morrison, H. G., Raffals, L., Chang, E. B., Huffnagle, G. B., Schmidt, T. M., Cole, J. R., & Tiedje, J. M. (2013). 91ל91ם&Բ;Microbiome, 1(1), 8. doi:10.1186/2049-2618-1-.

Woodring, J. L., Bland, N. D., Ochiana, S. O., Campbell, R. K., & Pollastri, M. P. (2013). 91ל91ם&Բ;Bioorg Med Chem Lett, 23(21), 5971-5974. doi:10.1016/j.bmcl.2013.08.05.

Young, V. B., Raffals, L. H., Huse, S. M., Vital, M., Dai, D., Schloss, P. D., Brulc, J. M., Antonopoulos, D. A., Arrieta, R. L., Kwon, J. H., Reddy, K. G., Hubert, N. A., Grim, S. L., Vineis, J. H., Dalal, S., Morrison, H. G., , Meyer, F., Schmidt, T. M., Tiedje, J. M., Chang, E. B., & Sogin, M. L. (2013). 91ל91ם&Բ;Microbiome, 1(1), 9. doi:10.1186/2049-2618-1-.

Zettler, E. R., Mincer, T. J., & Amaral-Zettler, L. A. (2013). 91לLife in the 91לplastisphere91ם: microbial communities on plastic marine debris.91ם&Բ;Environ Sci Technol, 47(13), 7137-7146. doi:10.1021/es401288.

2012

Alliegro, M. C., Hartson, S., & Alliegro, M. A. (2012). 91ל91ם&Բ;J Biol Chem, 287(9), 6702-6713. doi:10.1074/jbc.M111.28850.

Amaral-Zettler, L. A. (2012). 91ל91ם&Բ;Front Microbiol, 3, 441. doi:10.3389/fmicb.2012.0044.

Arkhipova, I. R. (2012). 91ל91ם&Բ;In N. F. Lue & C. Autexier (Ed.), Telomerases: Chemistry, Biology and Clinical Applications (pp. 265-299). Hoboken, NJ: Wiley and Sons, Inc. .

Arkhipova, I. R., Batzer, M. A., Brosius, J., Feschotte, C., Moran, J. V., Schmitz, J., & Jurka, J. (2012). 91ל91ם&Բ;Mob DNA, 3(1), 19. doi:10.1186/1759-8753-3-1.

Atamna-Ismaeel, N., Finkel, O. M., Glaser, F., Sharon, I., Schneider, R., Post, A. F., Spudich, J. L., von Mering, C., Vorholt, J. A., Iluz, D., Beja, O., & Belkin, S. (2012). 91ל91ם&Բ;Environ Microbiol, 14(1), 140-146. doi:10.1111/j.1462-2920.2011.02554..

Beg, Q. K., Zampieri, M., Klitgord, N., Collins, S. B., Altafini, C., , & Segre, D. (2012). 91ל91ם&Բ;Nucleic Acids Res, 40(15), 7132-7149. doi:10.1093/nar/gks46.

Bowen, J. L., Morrison, H. G., Hobbie, J. E., & Sogin, M. L. (2012). 91ל91ם&Բ;ISME J, 6(11), 2014-2023. doi:10.1038/ismej.2012.4.

Brandt, B. W., Bonder, M. J., Huse, S. M., & Zaura, E. (2012). 91ל91ם&Բ;Nucleic Acids Res, 40(Web Server issue), W82-87. doi:10.1093/nar/gks41.

Breier, J. A., Gomez-Ibanez, D., , , & Emerson, D. (2012). 91ל91ם&Բ;Deep-Sea Research Part I-Oceanographic Research Papers, 70(0), 83-90. doi:DOI 10.1016/j.dsr.2012.10.00.

Chandsawangbhuwana, C., Shi, L. Z., Zhu, Q., Alliegro, M. C., & Berns, M. W. (2012). 91ל91ם&Բ;J Biomed Opt, 17(1), 015001. doi:10.1117/1.JBO.17.1.01500.

Chapman, M., & Alliegro, M. C. (2012). 91ל91ם&Բ;Q Rev Biol, 87(4), 315-324.

Crump, B. C., Amaral-Zettler, L. A., & Kling, G. W. (2012). 91ל91ם&Բ;ISME J, 6(9), 1629-1639. doi:10.1038/ismej.2012..

Davies, N., Meyer, C., , Amaral-Zettler, L. A., Deck, J., Bicak, M., Rocca-Serra, P., Assunta-Sansone, S., Willis, K., & Field, D. (2012). 91ל91ם&Բ;Gigascience, 1(1), 5. doi:10.1186/2047-217X-1-.

Filkins, L. M., Hampton, T. H., Gifford, A. H., Gross, M. J., Hogan, D. A., Sogin, M. L., Morrison, H. G., Paster, B. J., & O91יToole, G. A. (2012). 91ל91ם&Բ;J Bacteriol, 194(17), 4709-4717. doi:10.1128/JB.00566-1.

Finkel, O. M., Burch, A. Y., Elad, T., Huse, S. M., Lindow, S. E., Post, A. F., & Belkin, S. (2012). 91ל91ם&Բ;Appl Environ Microbiol, 78(17), 6187-6193. doi:10.1128/AEM.00888-1.

 L., &  (2012). 91ל91ם&Բ;Integr Comp Biol, 52(6), 842-849. doi:10.1093/icb/ics11.

Freitas, S., Hatosy, S., Fuhrman, J. A., Huse, S. M., Mark Welch, D. B., Sogin, M. L., & Martiny, A. C. (2012). 91ל91ם&Բ;ISME J, 6(8), 1499-1505. doi:10.1038/ismej.2012..

, Steele, J. A., Caporaso, J. G., Steinbruck, L., Reeder, J., Temperton, B., Huse, S. M., McHardy, A. C., Knight, R., Joint, I., Somerfield, P., Fuhrman, J. A., & Field, D. (2012). 91ל91ם&Բ;ISME J, 6(2), 298-308. doi:10.1038/ismej.2011.10.

Gobet, A., Boer, S. I., Huse, S. M., van Beusekom, J. E., Quince, C., Sogin, M. L., Boetius, A., & Ramette, A. (2012). 91ל91ם&Բ;ISME J, 6(3), 542-553. doi:10.1038/ismej.2011.13.

Gribble, K. E., & Mark Welch, D. B. (2012). 91ל91ם&Բ;BMC Evol Biol, 12(1), 134. doi:10.1186/1471-2148-12-13.

Huse, S. M., Ye, Y., Zhou, Y., & Fodor, A. A. (2012). 91ל91ם&Բ;PLoS One, 7(6), e34242. doi:10.1371/journal.pone.003424.

Kozul-Horvath, C. D., Zandbergen, F., Jackson, B. P., Enelow, R. I., & Hamilton, J. W. (2012). 91ל91ם&Բ;PLoS One, 7(5), e38249. doi:10.1371/journal.pone.003824.

Lasek-Nesselquist, E. (2012). 91ל91ם&Բ;PLoS One, 7(8), e43554. doi:10.1371/journal.pone.004355.

Looft, T., Johnson, T. A., Allen, H. K., Bayles, D. O., Alt, D. P., Stedtfeld, R. D., , Stedtfeld, T. M., Chai, B., Cole, J. R., Hashsham, S. A., Tiedje, J. M., & Stanton, T. B. (2012). 91ל91ם&Բ;Proc Natl Acad Sci U S A, 109(5), 1691-1696. doi:10.1073/pnas.112023810.

Mackey, K. R. M., Roberts, K., Lomas, M. W., Saito, M. A., Post, A. F., & Paytan, A. (2012). 91ל91ם&Բ;Environ Sci Technol, 46(19), 10438-10446. doi:10.1021/es300799.

Madan, J. C., Koestler, D. C., Stanton, B. A., Davidson, L., Moulton, L. A., Housman, M. L., Moore, J. H., Guill, M. F., Morrison, H. G., Sogin, M. L., Hampton, T. H., Karagas, M. R., Palumbo, P. E., Foster, J. A., Hibberd, P. L., & O91יToole, G. A. (2012). 91ל91ם&Բ;MBio, 3(4). doi:10.1128/mBio.00251-1.

Madan, J. C., Salari, R. C., Saxena, D., Davidson, L., O91יToole, G. A., Moore, J. H., Sogin, M. L., Foster, J. A., Edwards, W. H., Palumbo, P., & Hibberd, P. L. (2012). 91ל91ם&Բ;Arch Dis Child Fetal Neonatal Ed, 97(6), F456-462. doi:10.1136/fetalneonatal-2011-30137.

McCliment, E. A., Nelson, C. E., Carlson, C. A., Alldredge, A. L., Witting, J., & Amaral-Zettler, L. A. (2012). 91ל91ם&Բ;ISME J, 6(2), 309-319. doi:10.1038/ismej.2011.10.

Meeder, E., Mackey, K. R. M., Paytan, A., Shaked, Y., Iluz, D., Stambler, N., Rivlin, T., Post, A. F., & Lazar, B. (2012). 91ל91ם&Բ;Marine Ecology Progress Series, 453, 11-26. doi:10.3354/meps0952.

Ochiana, S. O., Gustafson, A., Bland, N. D., Wang, C., Russo, M. J., Campbell, R. K., & Pollastri, M. P. (2012). 91ל91ם&Բ;Part 2. Tadalafil analogs. Bioorg Med Chem Lett, 22(7), 2582-2584. doi:10.1016/j.bmcl.2012.01.11.

Ozok, A. R., Persoon, I. F., Huse, S. M., Keijser, B. J., Wesselink, P. R., Crielaard, W., & Zaura, E. (2012). 91ל91ם&Բ;Int Endod J, 45(6), 530-541. doi:10.1111/j.1365-2591.2011.02006..

Sansone, S. A., Rocca-Serra, P., Field, D., Maguire, E., Taylor, C., Hofmann, O., Fang, H., Neumann, S., Tong, W., Amaral-Zettler, L. A., Begley, K., Booth, T., Bougueleret, L., Burns, G., Chapman, B., Clark, T., Coleman, L. A., Copeland, J., Das, S., de Daruvar, A., de Matos, P., Dix, I., Edmunds, S., Evelo, C. T., Forster, M. J., Gaudet, P., Gilbert, J., Goble, C., Griffin, J. L., Jacob, D., Kleinjans, J., Harland, L., Haug, K., Hermjakob, H., Ho Sui, S. J., Laederach, A., Liang, S., Marshall, S., McGrath, A., Merrill, E., Reilly, D., Roux, M., Shamu, C. E., Shang, C. A., Steinbeck, C., Trefethen, A., Williams-Jones, B., Wolstencroft, K., Xenarios, I., & Hide, W. (2012). 91ל91ם&Բ;Nat Genet, 44(2), 121-126. doi:10.1038/ng.105.

Siam, R., Mustafa, G. A., Sharaf, H., Moustafa, A., Ramadan, A. R., Antunes, A., Bajic, V. B., Stingl, U., Marsis, N. G., Coolen, M. J., Sogin, M. L., Ferreira, A. J., & Dorry, H. E. (2012). 91ל91ם&Բ;PLoS One, 7(8), e42872. doi:10.1371/journal.pone.004287.

Smith, K. F., Schmidt, V. T., Rosen, G. E., & Amaral-Zettler, L. A. (2012). 91ל91ם&Բ;PLoS One, 7(9), e39971. doi:10.1371/journal.pone.003997.

Sogin, M. L. (2012). 91ל91ם&Բ;In S. Maloy & R. Kolter (Ed.), Microbes and Evolution: The World That Darwin Never Saw (pp. 31-37). Washington, DC: ASM Press.

Sukenik, A., Kaplan-Levy, R. N., Mark Welch, J. L., & Post, A. F. (2012). 91ל91ם&Բ;ISME J, 6(3), 670-679. doi:10.1038/ismej.2011.12.

Sun, Y., Cai, Y., Huse, S. M., Knight, R., Farmerie, W. G., Wang, X., & Mai, V. (2012). 91ל91ם&Բ;Brief Bioinform, 13(1), 107-121. doi:10.1093/bib/bbr00.

Takumi, K., Swart, A., Mank, T., Lasek-Nesselquist, E., Lebbad, M., Caccio, S. M., & Sprong, H. (2012). 91ל91ם&Բ;Parasit Vectors, 5, 168. doi:10.1186/1756-3305-5-16.

Theroux, S., Huang, Y., & Amaral-Zettler, L. (2012). 91ל91ם&Բ;Frontiers in Microbiology, 3, 415.

Toney, J. L., Theroux, S., Andersen, R. A., Coleman, A., Amaral-Zettler, L. A., & Huang, Y. S. (2012). 91ל91ם&Բ;Geochimica Et Cosmochimica Acta, 78, 51-64. doi:DOI 10.1016/j.gca.2011.11.02.

Valm, A. M., Mark Welch, J. L., &  (2012). 91ל91ם&Բ;Syst Appl Microbiol, 35(8), 496-502. doi:10.1016/j.syapm.2012.03.00.

Vandewalle, J. L., Goetz, G. W., Huse, S. M., Morrison, H. G., Sogin, M. L., Hoffmann, R. G., Yan, K., & McLellan, S. L. (2012). 91ל91ם&Բ;Environ Microbiol, 14(9), 2538-2552. doi:10.1111/j.1462-2920.2012.02757..

Ver Eecke, H. C., Butterfield, D. A., , Lilley, M. D., Olson, E. J., Roe, K. K., Evans, L. J., Merkel, A. Y., Cantin, H. V., & Holden, J. F. (2012). 91ל91ם&Բ;Proc Natl Acad Sci U S A, 109(34), 13674-13679. doi:10.1073/pnas.120663210.

Wang, C., Ashton, T. D., Gustafson, A., Bland, N. D., Ochiana, S. O., Campbell, R. K., & Pollastri, M. P. (2012). 91ל91ם&Բ;Part 1. Sildenafil analogs. Bioorg Med Chem Lett, 22(7), 2579-2581. doi:10.1016/j.bmcl.2012.01.11.

Wolf, B., Schwarzer, A., Cote, A. L., Hampton, T. H., Schwaab, T., Huarte, E., Tomlinson, C. R., Gui, J., Fisher, J. L., Fadul, C. E., Hamilton, J. W., & Ernstoff, M. S. (2012). 91ל91ם&Բ;PLoS One, 7(12), e50221. doi:10.1371/journal.pone.005022.

Yager, P. L., Sherrell, R. M., Stammerjohn, S. E., Alderkamp, A. C., Schofield, O., Abrahamsen, E. P., Arrigo, K. R., Bertilsson, S., Garay, D. L., Guerrero, R., Lowry, K. E., Moksnes, P. O., Ndungu, K., Post, A. F., Randall-Goodwin, E., Riemann, L., Severmann, S., Thatje, S., van Dijken, G. L., & Wilson, S. (2012). 91ל91ם&Բ;Oceanography, 25(3), 40-53. doi:.

2011

Agogue, H., Lamy, D., Neal, P. R., Sogin, M. L., & Herndl, G. J. (2011). 91ל91ם&Բ;Mol Ecol, 20(2), 258-274. doi:10.1111/j.1365-294X.2010.04932..

Akerman, N. H., Price, R. E., Pichler, T., & Amend, J. P. (2011). 91ל91ם&Բ;Geobiology, 9(5), 436-445. doi:10.1111/j.1472-4669.2011.00291..

Alliegro, M. C. (2011). 91ל91ם&Բ;Commun Integr Biol, 4(2), 147-149. doi:10.4161/cib.4.2.1454.

Alliegro, M. C. (2011). 91ל91ם&Բ;Chromosome Res, 19(3), 367-376. doi:10.1007/s10577-011-9186-.

Amaral-Zettler, L. A., Zettler, E. R., Theroux, S. M., Palacios, C., Aguilera, A., & Amils, R. (2011). 91ל91ם&Բ;ISME J, 5(1), 42-50. doi:10.1038/ismej.2010.10.

Bland, N. D., Wang, C., Tallman, C., Gustafson, A. E., Wang, Z., Ashton, T. D., Ochiana, S. O., McAllister, G., Cotter, K., Fang, A. P., Gechijian, L., Garceau, N., Gangurde, R., Ortenberg, R., Ondrechen, M. J., Campbell, R. K., & Pollastri, M. P. (2011). 91ל91ם&Բ;J Med Chem, 54(23), 8188-8194. doi:10.1021/jm201148.

Bogaert, D., Keijser, B., Huse, S. M., Rossen, J., Veenhoven, R., van Gils, E., Bruin, J., Montijn, R., Bonten, M., & Sanders, E. (2011). 91ל91ם&Բ;PLoS One, 6(2), e17035. doi:10.1371/journal.pone.001703.

Bowen, J. L., Ward, B. B., Morrison, H. G., Hobbie, J. E., Valiela, I., Deegan, L. A., & Sogin, M. L. (2011). 91ל91ם&Բ;ISME J, 5(9), 1540-1548. doi:10.1038/ismej.2011.2.

Crielaard, W., Zaura, E., Schuller, A. A., Huse, S. M., Montijn, R. C., & Keijser, B. J. (2011). 91ל91ם&Բ;BMC Med Genomics, 4, 22. doi:10.1186/1755-8794-4-2.

, Zozaya, M., Taylor, C. M., Dowd, S. E., Martin, D. H., & Ferris, M. J. (2011). 91ל91ם&Բ;PLoS One, 6(10), e26732. doi:10.1371/journal.pone.002673.

Field, D., Amaral-Zettler, L. A., Cochrane, G., Cole, J. R., Dawyndt, P., Garrity, G. M., Gilbert, J., Glockner, F. O., Hirschman, L., Karsch-Mizrachi, I., Klenk, H. P., Knight, R., Kottmann, R., Kyrpides, N., Meyer, F., San Gil, I., Sansone, S. A., Schriml, L. M., Sterk, P., Tatusova, T., Ussery, D. W., White, O., & Wooley, J. (2011). 91ל91ם&Բ;PLoS Biol, 9(6), e1001088. doi:10.1371/journal.pbio.100108.

Finkel, O. M., Burch, A. Y., Lindow, S. E., Post, A. F., & Belkin, S. (2011). 91ל91ם&Բ;Appl Environ Microbiol, 77(21), 7647-7655. doi:10.1128/AEM.05565-1.

Garbuz, D. G., Astakhova, L. N., Zatsepina, O. G., Arkhipova, I. R., Nudler, E., & Evgen91יev, M. B. (2011). 91ל91ם&Բ;PLoS One, 6(11), e27205. doi:10.1371/journal.pone.002720.

Garbuz, D. G., Yushenova, I. A., Zatsepina, O. G., Przhiboro, A. A., Bettencourt, B. R., & Evgen91יev, M. B. (2011). 91ל91ם&Բ;BMC Evol Biol, 11, 74. doi:10.1186/1471-2148-11-7.

Gast, R. J., Moran, D. M., Dennett, M. R., Wurtsbaugh, W. A., & Amaral-Zettler, L. A. (2011). 91ל91ם&Բ;J Water Health, 9(1), 37-52. doi:10.2166/wh.2010.10.

Gladyshev, E. A., & Arkhipova, I. R. (2011). 91ל91ם&Բ;Proc Natl Acad Sci U S A, 108(51), 20311-20316. doi:10.1073/pnas.110026610.

Gribble, K. E., Snell, T. W., & Mark Welch, D. B. (2011). 91ל91ם&Բ;Hydrobiologia, 662(1), 35-42. doi:DOI 10.1007/s10750-010-0482-.

Huse, S. M., & Mark Welch, D. (2011). 91ל91ם&Բ;J. de Bruijn (Ed.), Handbook of Molecular Microbial Ecology I: Metagenomics and Complementary Approaches (pp. 149-156): Wiley and Sons.

Kamennaya, N. A., & Post, A. F. (2011). 91ל91ם&Բ;Appl Environ Microbiol, 77(1), 291-301. doi:10.1128/AEM.01272-1.

Mackey, K. R. M., Bristow, L., Parks, D. R., Altabet, M. A., Post, A. F., & Paytan, A. (2011). 91ל91ם&Բ;Progress in Oceanography, 91(4), 545-560. doi:DOI 10.1016/j.pocean.2011.09.00.

Mark Welch, D. B., & Huse, S. H. (2011). 91ל91ם&Բ;In F. J. de Bruijn (Ed.), Handbook of Molecular Microbial Ecology II: Metagenomics in Different Habitats (pp. 245-252): Wiley and Sons.

Nelson, C. E., Alldredge, A. L., McCliment, E. A., Amaral-Zettler, L. A., & Carlson, C. A. (2011). 91ל91ם&Բ;ISME J, 5(8), 1374-1387. doi:10.1038/ismej.2011.1.

Nuzzio, D. B., Zettler, E. R., Aguilera, A., & Amaral-Zettler, L. A. (2011). 91ל91ם&Բ;Sci Total Environ, 409(10), 1984-1989. doi:10.1016/j.scitotenv.2011.01.00.

Oleksiak, M. F., Karchner, S. I., Jenny, M. J., Franks, D. G., Mark Welch, D. B., & Hahn, M. E. (2011). 91ל91ם&Բ;BMC Genomics, 12(1), 263. doi:10.1186/1471-2164-12-26.

Pawlowski, J., Christen, R., Lecroq, B., Bachar, D., Shahbazkia, H. R., Amaral-Zettler, L. A., & Guillou, L. (2011). 91ל91ם&Բ;PLoS One, 6(4), e18169. doi:10.1371/journal.pone.001816.

Perry, D. A., Morrison, H. G., & Adam, R. D. (2011). 91ל91ם&Բ;Mol Biochem Parasitol, 180(2), 112-114. doi:10.1016/j.molbiopara.2011.07.00.

Pollastri, M. P., & Campbell, R. K. (2011). 91ל91ם&Բ;Future Med Chem, 3(10), 1307-1315. doi:10.4155/fmc.11.9.

Post, A. F., Penno, S., Zandbank, K., Paytan, A., Huse, S. M., & Welch, D. M. (2011). 91ל91ם&Բ;Front Microbiol, 2, 131. doi:10.3389/fmicb.2011.0013.

Resing, J. A., Rubin, K. H., Embley, R. W., Lupton, J. E., Baker, E. T., Dziak, R. P., Baumberger, T., Lilley, M. D., , Shank, T. M., Butterfield, D. A., Clague, D. A., Keller, N. S., Merle, S. G., Buck, N. J., Michael, P. J., Soule, A., Caress, D. W., Walker, S. L., Davis, R., Cowen, J. P., Reysenbach, A. L., & Thomas, H. (2011). 91ל91ם&Բ;Nature Geoscience, 4(11), 799-806. doi:Doi 10.1038/Ngeo127.

Rodrigues, J. L., , & Tiedje, J. M. (2011). 91ל91ם&Բ;Appl Environ Microbiol, 77(15), 5352-5360. doi:10.1128/AEM.00097-1.

Shanks, O. C., Kelty, C. A., Archibeque, S., Jenkins, M., Newton, R. J., McLellan, S. L., Huse, S. M., & Sogin, M. L. (2011). 91ל91ם&Բ;Appl Environ Microbiol, 77(9), 2992-3001. doi:10.1128/AEM.02988-1.

Shanks, O. C., McLellan, S. L., Huse, S. M., & Sogin, M. L. (2011). 91ל91ם&Բ;. In K. Sen & N. J. Ashbolt (Ed.), In Environmental Microbiology: Current Technology and Water Applications. Norfolk, UK: Caister Academic Press.

Smith, H. A., Mark Welch, D. B., & Snell, T. W. (2011). 91ל91ם&Բ;Hydrobiologia, 662(1), 99-106. doi:10.1007/s10750-010-0484-.

, Morgan, J. R., Zottoli, S. J., Smith, P. J., Buxbaum, J. D., & Bloom, O. E. (2011). 91ל91ם&Բ;Biol Bull, 221(1), 18-34.

, Cole, J. R., Jesus Eda, C., Wang, Q., Farris, R. J., Fish, J. A., & Tiedje, J. M. (2011). 91ל91ם&Բ;Proc Natl Acad Sci U S A, 108(35), 14637-14642. doi:10.1073/pnas.111143510.

Valm, A. M., Mark Welch, J. L., Rieken, C. W., Hasegawa, Y., Sogin, M. L., Oldenbourg, R., Dewhirst, F. E., &  (2011). 91ל91ם&Բ;Proc Natl Acad Sci U S A, 108(10), 4152-4157. doi:10.1073/pnas.110113410.

White, J., , Hill, G., Hill, E., Huse, S. M., Weightman, A. J., & Mahenthiralingam, E. (2011). 91ל91ם&Բ;Appl Environ Microbiol, 77(13), 4527-4538. doi:10.1128/AEM.02317-1.

Xia, L. C., Steele, J. A., Cram, J. A., Cardon, Z. G., Simmons, S. L., Vallino, J. J., Fuhrman, J. A., & Sun, F. (2011). 91ל91ם&Բ;BMC Syst Biol, 5 Suppl 2, S15. doi:10.1186/1752-0509-5-S2-S1.

Yelton, A. P., Thomas, B. C., Simmons, S. L., Wilmes, P., Zemla, A., Thelen, M. P., Justice, N., & Banfield, J. F. (2011). 91ל91ם&Բ;PLoS Comput Biol, 7(10), e1002230. doi:10.1371/journal.pcbi.100223.

Yilmaz, P., , Knight, R., Amaral-Zettler, L. A., Karsch-Mizrachi, I., Cochrane, G., Nakamura, Y., Sansone, S. A., Glockner, F. O., & Field, D. (2011). 91ל91ם&Բ;ISME J, 5(10), 1565-1567. doi:10.1038/ismej.2011.3.

Yilmaz, P., Kottmann, R., Field, D., Knight, R., Cole, J. R., Amaral-Zettler, L. A., , Karsch-Mizrachi, I., Johnston, A., Cochrane, G., Vaughan, R., Hunter, C., Park, J., Morrison, N., Rocca-Serra, P., Sterk, P., Arumugam, M., Bailey, M., Baumgartner, L., Birren, B. W., Blaser, M. J., Bonazzi, V., Booth, T., Bork, P., Bushman, F. D., Buttigieg, P. L., Chain, P. S., Charlson, E., Costello, E. K., Huot-Creasy, H., Dawyndt, P., DeSantis, T., Fierer, N., Fuhrman, J. A., Gallery, R. E., Gevers, D., Gibbs, R. A., San Gil, I., Gonzalez, A., Gordon, J. I., Guralnick, R., Hankeln, W., Highlander, S., Hugenholtz, P., Jansson, J., Kau, A. L., Kelley, S. T., Kennedy, J., Knights, D., Koren, O., Kuczynski, J., Kyrpides, N., Larsen, R., Lauber, C. L., Legg, T., Ley, R. E., Lozupone, C. A., Ludwig, W., Lyons, D., Maguire, E., Methe, B. A., Meyer, F., Muegge, B., Nakielny, S., Nelson, K. E., Nemergut, D., Neufeld, J. D., Newbold, L. K., Oliver, A. E., Pace, N. R., Palanisamy, G., Peplies, J., Petrosino, J., Proctor, L., Pruesse, E., Quast, C., Raes, J., Ratnasingham, S., Ravel, J., Relman, D. A., Assunta-Sansone, S., Schloss, P. D., Schriml, L., Sinha, R., Smith, M. I., Sodergren, E., Spo, A., Stombaugh, J., Tiedje, J. M., Ward, D. V., Weinstock, G. M., Wendel, D., White, O., Whiteley, A., Wilke, A., Wortman, J. R., Yatsunenko, T., & Glockner, F. O. (2011). 91ל91ם&Բ;Nat Biotechnol, 29(5), 415-420. doi:10.1038/nbt.182.

Zinger, L., Amaral-Zettler, L. A., Fuhrman, J. A., Horner-Devine, M. C., Huse, S. M., Mark Welch, D. B., Martiny, J. B., Sogin, M. L., Boetius, A., & Ramette, A. (2011). 91ל91ם&Բ;PLoS One, 6(9), e24570. doi:10.1371/journal.pone.002457.